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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003162`

染色体: Chr05 坐标: 40404370-40406867 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003162`
名称	SmilChr05G003162
描述	uncharacterized SmilChr05G003162
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40404370 - 40406867 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024418`
GeneID	`131024418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024418`
原始查询	`SmilChr05G003162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA glycosylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745751]; symbol=AT1G13635; hit=AT1G13635; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DNA glycosylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745751]; symbol=AT1G13635; hit=AT1G13635; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G13635` (AT1G13635) DNA glycosylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745751] identity=61.3; qcov=0.968; evalue=5.72e-130; confidence=high
Rice	`Os08g0489300` (TagI) - identity=52.5; qcov=0.943; evalue=2.39e-99; confidence=high
GO	GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008725 (DNA-3-methyladenine glycosylase activity)
KEGG	smil03410 (Base excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03352 (Adenine_glyco)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809910.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057809911.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809910.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809910.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40404627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr5:40404649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:40405107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr5:40406022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B33,C83
`Chr5:40406065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809910.1

317 aa

158

317

Adenine_glyco

PF03352 Adenine_glyco 127-303 aa

XP_057809911.1

315 aa

158

315

Adenine_glyco

PF03352 Adenine_glyco 127-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809910.1`	Pfam	`PF03352`	Adenine_glyco	Family	127	303	4.6e-59	199.9	Methyladenine glycosylase
`XP_057809911.1`	Pfam	`PF03352`	Adenine_glyco	Family	127	301	1.1e-60	205.3	Methyladenine glycosylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953927.1
TAAATATAATACCCCCACACACACACTCATTTCAAGCTTAATTAAGGGGTTCATAATTATTACATATGCAGCTTTTTCTCAAATGTTATTAAAGTAAGCTAATCCATATTCATCACATAATTTCTTGGTTTAATTTATTTATGATTAGTATAATGTTACACTTGAGCTGATAAATAAGAGAATGATCATTCGCCTTAATCTGACCAATTCATATGCTCTGGCATATAATATTACTTGCAATAAACACCAAACACACAAAC...

XM_057953928.1
GACCAATTCATATGCTCTGGCATATAATATTACTTGCAATAAACACCAAACACACAAACTATGCTAGACTTTGACATTTGTTGTCAACCAATGCAACAGGTGTTTAGTAACTTGATTTGATTTTTTTTTTAAATTTAATTCCAAGCTGAAGCAGATTTTCATAATAGTTTCCAGAACAAGAATCTTTGTTGATAATGGCTGAAATTCAGGTGTCATTTTCAGCCACTATTTTACAAGCTTTTATTTAGTCTGTTGCTTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024418
ATGTGTGTTGATTCAGACATATCAAAGTTGCAAACATTTTTTAATATGTCTAAGCAGTATGAGAAGAAACAAGGCATGGAGAGGAGCAGGAGGGAGAAGGAGAAGGCGATGACTAACATATTTTCGAGGAATTTGAAGAGAATATACCCCATCGGCCTGCAAAGGACTTGCTCCGCGCTTTCCCTATCTTCGCTATCTCTGTCTTTGTCTCAGAACTCAACTGATTCCTCCTTGACAGACTCCTCCACCCCTATTGATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809910.1
MCVDSDISKLQTFFNMSKQYEKKQGMERSRREKEKAMTNIFSRNLKRIYPIGLQRTCSALSLSSLSLSLSQNSTDSSLTDSSTPIDHKISSALRLIAPAQRRLPKIVQQPALPIEEAPRRCNWITTNSDKVYVQFHDECWGVPVYDDNQLFELLAMCGMLMDFNWTEILKRRELLREAFGGFDANIVCKMGEKEIIEIASNKELSLAECRVRCIVDNARCITGASVVRECGSLSSYMWEYVSYKPMMNRFKYPKSVPLRS...

XP_057809911.1
MCVDSDISKLQTFFNMSKQYEKKQGMERSRREKEKAMTNIFSRNLKRIYPIGLQRTCSALSLSSLSLSLSQNSTDSSLTDSSTPIDHKISSALRLIAPAQRRLPKIVQQPALPIEEAPRRCNWITTNSDKVYVQFHDECWGVPVYDDNQLFELLAMCGMLMDFNWTEILKRRELLREAFGGFDANIVCKMGEKEIIEIASNKELSLAECRVRCIVDNARCITGVVRECGSLSSYMWEYVSYKPMMNRFKYPKSVPLRSPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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