当前解析结果
SmilChr05G003176| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003176 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003176 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003176 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 40673819 - 40674872 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024429 |
|---|---|
| GeneID | 131024429 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024429 |
| 原始查询 | SmilChr05G003176 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | AT1G13510; symbol=AT1G13510; hit=AT1G13510; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | AT1G13510; symbol=AT1G13510; hit=AT1G13510; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G13510 (AT1G13510)- identity=45.9; qcov=1.02; evalue=4.85e-32; confidence=medium |
| Rice | Os08g0413500- identity=37.7; qcov=1.11; evalue=2.16e-30; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024429 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057809922.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057809922.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057809922.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057809922.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809922.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:40674442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B3,C32,C65,D4 |
Chr5:40674527 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B12,B120,B91,D1 |
Chr5:40674658 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:40674661 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。