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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003183`

染色体: Chr05 坐标: 40740854-40741900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003183`
名称	SmilChr05G003183
描述	probable calcium-binding protein CML16
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40740854 - 40741900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024434`
GeneID	`131024434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024434`
原始查询	`SmilChr05G003183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML16
产物	probable calcium-binding protein CML16
Arabidopsis	`AT3G25600` (AT3G25600) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822147] identity=78.1; qcov=0.886; evalue=2.07e-86; confidence=high
Rice	`Os05g0577500` (OsCML14) - identity=63.7; qcov=0.897; evalue=1.64e-71; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0030234 (enzyme regulator activity)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809928.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809928.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057809928.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809928.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809928.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40741399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr5:40741460`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr5:40741460`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D7
`Chr5:40741603`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B109
`Chr5:40741603`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809928.1

175 aa

175

EF-hand_8

EF-hand_7

EF-hand_6

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_7

EF-hand_6

EF-hand_1

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF13833 EF-hand_8 15-41 aa PF13499 EF-hand_7 15-77 aa PF13405 EF-hand_6 16-45 aa PF13202 EF-hand_5 17-40 aa PF13202 EF-hand_5 56-73 aa PF13833 EF-hand_8 87-113 aa PF13499 EF-hand_7 90-151 aa PF13405 EF-hand_6 91-116 aa PF00036 EF-hand_1 92-118 aa PF13202 EF-hand_5 94-112 aa PF13833 EF-hand_8 107-149 aa PF00036 EF-hand_1 127-153 aa PF13202 EF-hand_5 130-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	15	41	4.7e-19	68.6	EF-hand domain pair
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	15	77	1.3e-30	106.2	EF-hand domain pair
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	16	45	3.3e-26	89.2	EF-hand domain
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	17	40	1.4e-23	82.0	EF hand
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	56	73	1.4e-23	82.0	EF hand
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	87	113	4.7e-19	68.6	EF-hand domain pair
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	90	151	1.3e-30	106.2	EF-hand domain pair
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	91	116	3.3e-26	89.2	EF-hand domain
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	92	118	2.6e-29	99.3	EF hand domain
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	94	112	1.4e-23	82.0	EF hand
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	107	149	4.7e-19	68.6	EF-hand domain pair
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	127	153	2.6e-29	99.3	EF hand domain
`XP_057809928.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	130	151	1.4e-23	82.0	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953945.1
CATATTAGGATCACATCTCTCTCTCTCTCTCTAGAAAAATACATCAAGAGAAGTTGCGAAGAATAGGTCAGTCACATGGATAAGTGAATAACATATGATAAAATAATAGTATAAGAGAGTTTGATGAAGTTAGTTACGCGTTTTGATGAATGAAGGAAAAGCGAAGTTAAAAAGAGGAGGAGCTCCAAAAAGCAAGTAGAGCCACAGGAATTGGGGGTTTGTTAGTAGTAATAGAATTGGGGAAAATGGTAGCAATCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024434
ATGGTAGCAATCGGAATGGCTAAGATGGAATCCGATCAGCTGAACCAGCTTCGGGACATCTTCGCCCGGTTCGACATGGACCACGACGGCAGCCTCACGCAGCTGGAGCTGGCCGCCCTCCTCCGCTCGCTGGGCCTCAAGCCCTCCGGCGACCAGATCCACGCCCTCCTCGCCAACATGGACGCCAACGGCAACGGCTCCATCGAGTTCCAGGAGCTGGTCGACGCTATCCTCCCCGACATCAACGACGAGGTCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809928.1
MVAIGMAKMESDQLNQLRDIFARFDMDHDGSLTQLELAALLRSLGLKPSGDQIHALLANMDANGNGSIEFQELVDAILPDINDEVLLNQDQLMEVFRSFDRDGNGYITAAELAGQMAKMGHPLTYRELSDMMQEADTNGDGVISLNEFATILGKSAVEFLGLSDSQSQSPSSSSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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