当前解析结果
SmilChr05G003184| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003184 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003184 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003184 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 40755127 - 40756006 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025932 |
|---|---|
| GeneID | 131025932 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025932 |
| 原始查询 | SmilChr05G003184 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025932 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811694.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057811694.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811694.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811694.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811694.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:40755139 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C45 |
Chr5:40755179 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B52,B75,C29,C35,C7 |
Chr5:40755196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B10,B13,B4,C76,D4 |
Chr5:40755198 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,B93,D11 |
Chr5:40755199 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B10,B13,B4,C76,D4 |
Chr5:40755200 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B102 |
Chr5:40755200 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr5:40755227 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 86 | A1,A10,A11,A14,A15,A18,A20,A3,A7,A9,B100,B102,B103,B105,B109,B114,B117,B120,B123,B127,B130,B132,B136,B14,B15,B28,B30,B31,B32,B34,B41,B44,B45,B51,B54,B58,B59,B60,B63,B65,B66,B70,B71,B72,B73,B79,B8,B82,B83,B85,B86,B9,B90,B91,B92,B93,B95,C12,C13,C14,C15,C18,C20,C21,C30,C33,C34,C37,C39,C41,C49,C50,C52,C54,C57,C6,C70,C77,C83,C84,D10,D11,D2,D7,D8,D9 |
Chr5:40755241 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr5:40755248 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B102,B93,D11 |
Chr5:40755248 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,B93,D11 |
Chr5:40755259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。