当前解析结果
SmilChr05G003204| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003204 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003204 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003204 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 41015540 - 41020617 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025937 |
|---|---|
| GeneID | 131025937 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025937 |
| 原始查询 | SmilChr05G003204 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025937 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 0.40000 | XP_057811698.1 |
| 2 | Secretory vesicle | Secretory vesicle | 0.40000 | XP_057811698.1 |
| 3 | Acrosome | Acrosome | 0.40000 | XP_057811698.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057811698.1 |
| 5 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057811698.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:41015544 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B38,B82,B84,C37,C59,C74,D7,D8 |
Chr5:41015550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B110,B125,B5,B56,B78,B82,B90,B91,B96,C22,C47 |
Chr5:41015564 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B23,B63,C19,C32,C40 |
Chr5:41015564 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B23,B63,C19,C32,C40 |
Chr5:41015605 |
G |
GTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 11 | B108,B117,B123,B13,B31,B92,C47,C5,C53,C66,C82 |
Chr5:41015634 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B140,B98,C39 |
Chr5:41015639 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr5:41015653 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | B125,B129,B131,B17,B38,B39,B6,C37,C63,C70,C82,D1 |
Chr5:41015665 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr5:41015672 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr5:41018362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C25,C38 |
Chr5:41018363 |
A |
AGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 55 | A11,A16,A2,A20,A21,A3,A9,B105,B106,B118,B12,B128,B131,B137,B22,B26,B28,B29,B30,B33,B40,B55,B68,B7,B75,B78,B83,B84,B88,B90,B92,B98,C10,C13,C15,C2,C22,C33,C39,C4,C5,C50,C55,C6,C60,C61,C63,C71,C72,C78,C80,C82,D1,D4,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。