当前解析结果
SmilChr05G003210| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003210 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003210 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003210 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 41154283 - 41155149 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025939 |
|---|---|
| GeneID | 131025939 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025939 |
| 原始查询 | SmilChr05G003210 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025939 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811700.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057811700.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057811700.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.20000 | XP_057811700.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057811700.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:41154289 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B45 |
Chr5:41154327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B108,B21 |
Chr5:41154329 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B28,B6 |
Chr5:41154333 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B67,C57,C70 |
Chr5:41154335 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B127,B41,B70,B73,C23 |
Chr5:41154343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 39 | A24,A8,B102,B104,B107,B112,B113,B123,B128,B14,B26,B41,B43,B49,B56,B58,B62,B68,B7,B71,B72,B85,B88,C15,C25,C3,C32,C38,C39,C43,C45,C48,C59,C63,C64,C66,C68,C82,D8 |
Chr5:41154362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B103,B67,C57,C70 |
Chr5:41154363 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B67,C57,C70 |
Chr5:41154368 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,C85,D11,D7 |
Chr5:41154406 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr5:41154418 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C23,C36,C61 |
Chr5:41154444 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,C36,C61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。