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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003218`

染色体: Chr05 坐标: 41283331-41285020 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003218`
名称	SmilChr05G003218
描述	nudix hydrolase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	41283331 - 41285020 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024459`
GeneID	`131024459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024459`
原始查询	`SmilChr05G003218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 1-like
产物	nudix hydrolase 1-like
Arabidopsis	`AT1G68760` (NUDX1) nudix hydrolase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843207] identity=57.5; qcov=0.777; evalue=4.29e-57; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006203 (dGTP catabolic process); GO:0035539 (8-oxo-7,8-dihydrodeoxyguanosine triphosphate pyrophosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809952.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057809952.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809952.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809952.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:41283478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:41283486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C48
`Chr5:41283517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B139,C4,D2
`Chr5:41283573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:41283714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:41284947`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr5:41284947`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809952.1

188 aa

188

NUDIX

PF00293 NUDIX 53-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809952.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	53	167	1e-17	65.1	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953969.1
CTCCTTTATAAAAAATATTTCCAGTTGCTTGAGATTTGAGGCAAACTATATATACCTACCACGTTCATATATATTACAGTATATTAGTATTAGTACCATATTGAATGCAGCAGCAGCACTATGGCATTTATGATTAGCACTAAAATTCTCTCAACCGCCAAACCTATTTCCCCATTTCACAAATATGACTCCAAGCGTTCAGAAATTTTACGGGCGAATAAGCGCCGCCGGCTGCACGTGTCGTCATCTGCGGCGGTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024459
ATGGCATTTATGATTAGCACTAAAATTCTCTCAACCGCCAAACCTATTTCCCCATTTCACAAATATGACTCCAAGCGTTCAGAAATTTTACGGGCGAATAAGCGCCGCCGGCTGCACGTGTCGTCATCTGCGGCGGTGCCGGAGCAACCTACGCTAGAAGTTGGGGTGCAGGTGTTTCTGTTGAACGGGAATAAAGTGCTGATGGGCCGCCGCCGCACCGCTATAGGCGACGGCCACTTCGCCCTTCCCGGCGGTCACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809952.1
MAFMISTKILSTAKPISPFHKYDSKRSEILRANKRRRLHVSSSAAVPEQPTLEVGVQVFLLNGNKVLMGRRRTAIGDGHFALPGGHLEFGESFEECAYREVKEETGLEISGMEILTITNNVIMEPRAMHLVAVMMRAALAHPNQQPLNVEPLKCDGWDWYDWDHLPNPLLLTLQTAILGGLNPFPPNY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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