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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003226`

染色体: Chr05 坐标: 41397873-41401672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003226`
名称	SmilChr05G003226
描述	uncharacterized SmilChr05G003226
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	41397873 - 41401672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025943`
GeneID	`131025943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025943`
原始查询	`SmilChr05G003226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=26.7; qcov=0.445; evalue=5.26e-33; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811704.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811704.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811704.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811704.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:41397877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B63,B90,B92,C23
`Chr5:41398727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B15,B33,B59
`Chr5:41398745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B4,C19,C34
`Chr5:41398745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C19,C34
`Chr5:41398746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B13,B35,B85
`Chr5:41398760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr5:41398772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:41398782`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B128,B138,B15,B27,B31,B6,B7,C20,C26,C37,C57,C81,C86,D6
`Chr5:41398784`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B125,B13,B35,B85
`Chr5:41398784`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B125,B13,B35,B85
`Chr5:41398799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:41398806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B35,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811704.1

681 aa

340

681

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 125-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811704.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	125	280	4.9e-30	105.9	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955721.1
ATGAGCAAAGGAAAATCGAATGATTTCGATGATTCTATTGTGAATGACCTGAAACAAATGATCGAGGATAGCAGTCCATATGCAAAGATTTATAGAATGGCTGCTGATCATATTTCACGAGATAACTCAGTGGATGTGAAGCTTCGTCTCATAGGAAAAAGATCAAGAGATGGAAGGACATACAATATGCCAACTACAACAGAGGTGGCTACTCTTATTGTTGGAGATTTTGAGTGTATGCCTGATAAGAGAGACCCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025943
ATGAGCAAAGGAAAATCGAATGATTTCGATGATTCTATTGTGAATGACCTGAAACAAATGATCGAGGATAGCAGTCCATATGCAAAGATTTATAGAATGGCTGCTGATCATATTTCACGAGATAACTCAGTGGATGTGAAGCTTCGTCTCATAGGAAAAAGATCAAGAGATGGAAGGACATACAATATGCCAACTACAACAGAGGTGGCTACTCTTATTGTTGGAGATTTTGAGTGTATGCCTGATAAGAGAGACCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811704.1
MSKGKSNDFDDSIVNDLKQMIEDSSPYAKIYRMAADHISRDNSVDVKLRLIGKRSRDGRTYNMPTTTEVATLIVGDFECMPDKRDPKRERKKKDESQSSDPSKKKKNNEEESEESKRNNLTLREFLAFRMQDREDEGQQLLLSRRLLQQFIVDGYTMMETQMLQWIRYNQPSLRSERYNNLNDSKNKGNTDSSCVGKPLILPSSFTGGKWWTGYPSLFITFTCNPKWPEISRFVKKRELRPEDRQDISVRIFRIKLRELL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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