当前解析结果
SmilChr05G003237| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003237 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003237 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 89A2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 41609002 - 41610699 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024478 |
|---|---|
| GeneID | 131024478 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024478 |
| 原始查询 | SmilChr05G003237 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 89A2-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 89A2-like |
| Arabidopsis | AT5G03490 (AT5G03490)UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831823] identity=48.71; qcov=0.974; evalue=3.03e-148; confidence=high |
| Rice | Os08g0489100- identity=41.94; qcov=0.97; evalue=4.93e-102; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024478 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057809967.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057809967.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:41609475 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B134 |
Chr5:41609475 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr5:41609477 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C52,C84 |
Chr5:41609478 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr5:41609480 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr5:41609563 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr5:41609633 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B30,B47,C74 |
Chr5:41609697 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809967.1PF00201
UDPGT 267-395 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809967.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 267 | 395 | 6e-14 | 52.5 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。