当前解析结果
SmilChr05G003246| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003246 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003246 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003246 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 41842576 - 41843049 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025947 |
|---|---|
| GeneID | 131025947 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025947 |
| 原始查询 | SmilChr05G003246 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025947 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811709.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057811709.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811709.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811709.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811709.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:41842587 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,B62,C44 |
Chr5:41842593 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,C47,C68,D8 |
Chr5:41842600 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C80 |
Chr5:41842601 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr5:41842607 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,B7 |
Chr5:41842646 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 61 | A23,A24,A25,A6,B1,B110,B120,B125,B16,B2,B23,B26,B3,B34,B36,B45,B49,B50,B54,B55,B60,B63,B64,B66,B69,B78,B8,B85,B88,B89,B94,B97,C1,C10,C17,C19,C2,C22,C23,C27,C28,C29,C34,C37,C41,C45,C46,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C6,C63,C69,C74,C78,C79,C81,C85 |
Chr5:41842683 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr5:41842690 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A21,B10,B8,B88,C22,C48,D11 |
Chr5:41842710 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B26,B58,C43,C45 |
Chr5:41842723 |
CTA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A10,A20,A5,B107,B33,C52,C71,D4 |
Chr5:41842747 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,D6 |
Chr5:41842774 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 40 | A10,A11,A16,A18,B10,B115,B117,B118,B12,B124,B128,B19,B23,B24,B25,B36,B4,B42,B51,B52,B8,B83,B89,B98,C10,C20,C24,C3,C34,C42,C43,C46,C48,C59,C60,C69,C84,D2,D3,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。