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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003265`

染色体: Chr05 坐标: 42251856-42253119 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003265`
名称	SmilChr05G003265
描述	transcription factor TCP12-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	42251856 - 42253119 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024626`
GeneID	`131024626`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024626`
原始查询	`SmilChr05G003265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP12-like
产物	transcription factor TCP12-like
Arabidopsis	`AT1G68800` (TCP12) TCP domain protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843212] identity=72.2; qcov=0.229; evalue=8.87e-29; confidence=weak
Rice	`Os03g0706500` (FC1) - identity=41.5; qcov=0.506; evalue=1.64e-24; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:2000032 (regulation of secondary shoot formation)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024626

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810112.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810112.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810112.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810112.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:42252165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:42252211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr5:42252258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B75,C35
`Chr5:42252356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr5:42252386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B13,C60,C62,D3
`Chr5:42252395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr5:42252440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C35
`Chr5:42252598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:42252623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B55
`Chr5:42252783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B44,B50,C54,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810112.1

314 aa

157

314

TCP

PF03634 TCP 85-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810112.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	85	214	1e-43	150.3	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954129.1
CTCCTCCATCCCCATCAATAGCTCTGAAATACATGGTGTATTTTTCAACAGTTAAATCTGTAACCCTTCCGATCGAGATCGAGTTAGATCTCTCTCCTTTAAAACCTCGCCACCAAATTCGAAAAAGACAATAATTGTTGCATTTACAAGCCATGTTTCCCTCACCCAACCCCAACTGCAACAACCCTTTTGAATCCTTGCTCAAAATAAGGCCATCATCTGATCAAAAACACGATGAACTCCTCTTCAACTTCCCCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024626
ATGTTTCCCTCACCCAACCCCAACTGCAACAACCCTTTTGAATCCTTGCTCAAAATAAGGCCATCATCTGATCAAAAACACGATGAACTCCTCTTCAACTTCCCCTCGCCCTTCCTCGACGAGCACGAGTCGCCCTTGAATCAAATCTTCCTCCTCTCCGCCGATCATGACAAGAGAAGCAAGTCGGAAATGGATCATCGTGAGATCCCCCCCAGCAGCGCCCCTGCTGCTCCGCAGAGGCGGCGGAGGGCCGGGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810112.1
MFPSPNPNCNNPFESLLKIRPSSDQKHDELLFNFPSPFLDEHESPLNQIFLLSADHDKRSKSEMDHREIPPSSAPAAPQRRRRAGKKDRHSKICTAQGIRDRRMRLSLQVARKFFDLQDMLGYDKASKTIDWLFTQSNKAIKELHRSPPPLPNNSDVKSESFLSECEDLSGIEEINSNAAITPNPTQMAVKPSSTKASREKARARARCRTREKMLVKRLHISGDSFKPNPNHIEAPGGGDQQLINPYVDQIRVSQELSDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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