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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003266`

染色体: Chr05 坐标: 42300680-42303210 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003266`
名称	SmilChr05G003266
描述	uncharacterized SmilChr05G003266
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	42300680 - 42303210 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025951`
GeneID	`131025951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025951`
原始查询	`SmilChr05G003266`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=51.6; qcov=0.215; evalue=7.81e-14; confidence=weak
Rice	`Os01g0872900` - identity=46.9; qcov=1; evalue=3.25e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811713.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057811713.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811713.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811713.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811713.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:42300705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:42300740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr5:42300744`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A13,A18,B110,B21,B44,B45,B62,C42,C61
`Chr5:42300755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:42300757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B4,D4
`Chr5:42302346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B86,C77
`Chr5:42302351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr5:42302383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:42302390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B74,C8
`Chr5:42302394`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr5:42302394`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr5:42302398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811713.1

289 aa

144

289

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 55-222 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811713.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	55	222	4.9e-75	252.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955730.1
ATGGCCTTGCAACTGGCTGCATCTCCAGCGCAGCCACCCTCCCAGCGACCCAGATCGATCCGGCCTTCGCCTCCTCGGGTGGAGATGCTCTTAGGAGAGTCGACGGCGTTGGAATGCTTGAAGAAATTCTGCAAGGCCGTCGTTCGTATCTTTGGCGGCATGTATTTGAGGCGGCCAACAACTGCCGATGTGCAACGCATCACTGCAATGCACGAAGCCCGCCATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGATTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025951
ATGGCCTTGCAACTGGCTGCATCTCCAGCGCAGCCACCCTCCCAGCGACCCAGATCGATCCGGCCTTCGCCTCCTCGGGTGGAGATGCTCTTAGGAGAGTCGACGGCGTTGGAATGCTTGAAGAAATTCTGCAAGGCCGTCGTTCGTATCTTTGGCGGCATGTATTTGAGGCGGCCAACAACTGCCGATGTGCAACGCATCACTGCAATGCACGAAGCCCGCCATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGATTGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811713.1
MALQLAASPAQPPSQRPRSIRPSPPRVEMLLGESTALECLKKFCKAVVRIFGGMYLRRPTTADVQRITAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEAAVHFLANNSHHTRGYYLTDGIYPDWPVFVKSFQFPNDEKKRRFKVMQEAARKDVERAFGVLQARWEAGNASNFDGDDGEGPSSTPQTQFNSGAPPEFAAYLARN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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