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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003268`

染色体: Chr05 坐标: 42325292-42326206 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003268`
名称	SmilChr05G003268
描述	uncharacterized SmilChr05G003268
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	42325292 - 42326206 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025952`
GeneID	`131025952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025952`
原始查询	`SmilChr05G003268`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=36.2; qcov=0.609; evalue=9.88e-28; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=46.6; qcov=1; evalue=2.21e-93; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811714.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057811714.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811714.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811714.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:42325412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B91
`Chr5:42325455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:42325471`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B102
`Chr5:42325471`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B102
`Chr5:42325486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B52,B65,C29
`Chr5:42325493`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A13,A5,B1,B105,B108,B110,B128,B13,B132,B2,B22,B3,B33,B4,B45,B5,B50,B51,B64,B67,B68,B92,B93,C18,C34,C36,C42,C46,C48,C52,C55,C56,C60,C65,C68,C7,C80,C87,C9,D2,D4,D5
`Chr5:42325507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B18,B21,B40,C24
`Chr5:42325535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr5:42325559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B129,B18,B21,B40,B54,C24,C67,C9
`Chr5:42325566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B13,B31,B4,D4
`Chr5:42325566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B31,B4,D4
`Chr5:42325568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811714.1

304 aa

152

304

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 72-111 aa PF04827 Plant_tran 180-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811714.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	72	111	1.5e-19	70.2	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811714.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	180	304	5.9e-62	209.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955731.1
ATGTTTGTCAATGAAAACTCTTTAGTTGATTCAGACTCAAGTTCTGATGTTTCTCATTCCAATGAACTTGATGAATGGAAAGAACGAATTTATCATCAAAATCGTCAATTTGATAACATCATCCAAAATATGATCCTAAACAATCATAATCTGATTGCAGGACATCAAATTCCAATATCCAACAAGAGATATTGTGATAGGGCACGCGAGTTTGGCGCAGAGCATTTGATCAACGACTACTTCAGTGACAGCCCAACGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025952
ATGTTTGTCAATGAAAACTCTTTAGTTGATTCAGACTCAAGTTCTGATGTTTCTCATTCCAATGAACTTGATGAATGGAAAGAACGAATTTATCATCAAAATCGTCAATTTGATAACATCATCCAAAATATGATCCTAAACAATCATAATCTGATTGCAGGACATCAAATTCCAATATCCAACAAGAGATATTGTGATAGGGCACGCGAGTTTGGCGCAGAGCATTTGATCAACGACTACTTCAGTGACAGCCCAACGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811714.1
MFVNENSLVDSDSSSDVSHSNELDEWKERIYHQNRQFDNIIQNMILNNHNLIAGHQIPISNKRYCDRAREFGAEHLINDYFSDSPTYTPEIFRRRFRMQKLLFIRIVEVVTANDEFFQQRRDATDRVGLSSLQKCTGAMRVFAYRISSDVVDEYLRTSSSSKRDVLVYFVEGVISCFDGTYLRRPNEEDLTRLLYVGEQRGFPGMIGSIDCMHWEWKNCPNAWAGQYTGRSGKPTIILEAVASYDLWIWHALFGTPGLCN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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