当前解析结果
SmilChr05G003273| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003273 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003273 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003273 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 42524850 - 42525194 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025956 |
|---|---|
| GeneID | 131025956 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025956 |
| 原始查询 | SmilChr05G003273 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025956 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811717.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057811717.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811717.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811717.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811717.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:42524875 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr5:42524900 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B1,B121,B68,B78,C27,C87 |
Chr5:42524924 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 17 | A3,B121,B41,B48,B53,B58,B59,B66,B70,B75,B89,C33,C37,C4,C51,C77,C80 |
Chr5:42524929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr5:42524977 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B88,C67 |
Chr5:42524994 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr5:42525009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr5:42525010 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B40,C22 |
Chr5:42525013 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C67 |
Chr5:42525022 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B121,B54,C35,C87 |
Chr5:42525041 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B139,B15,C49 |
Chr5:42525071 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B110,B124,B16,C22 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。