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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003291`

染色体: Chr05 坐标: 43002238-43004539 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003291`
名称	SmilChr05G003291
描述	transcription factor HHO2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43002238 - 43004539 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024644`
GeneID	`131024644`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024644`
原始查询	`SmilChr05G003291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor HHO2-like
产物	transcription factor HHO2-like
Arabidopsis	`AT1G25550` (AT1G25550) myb-like transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839142] identity=48.8; qcov=0.875; evalue=2.9e-92; confidence=high
Rice	`Os02g0325600` (NIGT1) - identity=44.6; qcov=1.01; evalue=6.31e-78; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF26575 (HHO5_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024644

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810131.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810131.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810131.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810131.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43002777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C15,C52,C84
`Chr5:43002921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:43002995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr5:43003497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:43003498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:43004209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:43004233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:43004290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,D11
`Chr5:43004324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:43004332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810131.1

375 aa

188

375

HHO5_N

Myb_DNA-binding

PF26575 HHO5_N 3-61 aa PF00249 Myb_DNA-binding 211-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810131.1`	Pfam	`PF26575`	HHO5_N	Domain	3	61	2.4e-16	60.2	HHO5-like, N-terminal domain
`XP_057810131.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	211	262	3.3e-07	31.0	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954148.1
TATCTCTACTCTAACAAAAGATAACATTCAAAGATTCGTTTGTACGCGACGGCCCGACATCGACAACTCACGCACCCCTCGCTTCCTCCTACGCTTCAAAACCAAAACACAAAGAAAAAAATGTGAGAAATTCGCTCATTAAAATTTCCTTCTCTCTCATCGAAATCAGACAATAAATATATATATATAAGAGCAGTAGCAATATATATTTTCTCTTGTGAAAGCAAGTTTATTCCATTTGGTGATTCTACTTAGATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024644
ATGACGATCAACACCCATAATCACAATCACACTGATCATAATTCCCCTGAGAAAATGCAGGGATGCCAAGATCGCATCCACGCCTTAGAAGAAGAGCGTCGCAAGATTCAAGTTTTCAGTCGCGAACTCCCCCTCTGCCTCGACCTCGTCACACAAGCGATTGAGGCATGCAAGCAGCAGTTATCAGGCACCACAACGGAGTATAATCTAAACGGGCAATCGGAATGTTCGGAGCAGACATCAAGCGACGCTCCAGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810131.1
MTINTHNHNHTDHNSPEKMQGCQDRIHALEEERRKIQVFSRELPLCLDLVTQAIEACKQQLSGTTTEYNLNGQSECSEQTSSDAPVLEEFIPLKRASDGEEQESKKPEHDSTINIAKNCQKSDWLRSVQLWNQTPDLPSNEASPKKVGVSEVNRNGSGGAFHPFKKEKSQVGSGAVVVAPAPVNRSVPPASTSSSAETGDKKEGQSQRKARRCWSTELHRKFLQALQQLGGSHLATPKQIRELMKVDGLTNDEVKSHLQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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