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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003297`

染色体: Chr05 坐标: 43162436-43164677 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003297`
名称	SmilChr05G003297
描述	lysine histidine transporter-like 6
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43162436 - 43164677 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024652`
GeneID	`131024652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024652`
原始查询	`SmilChr05G003297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine histidine transporter-like 6
产物	lysine histidine transporter-like 6
Arabidopsis	`AT1G25530` (AT1G25530) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839139] identity=73.5; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0462400` (OsLHT9) - identity=64.4; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans); PF03222 (Trp_Tyr_perm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810142.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057810142.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810142.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810142.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810142.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43162809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B86
`Chr5:43162833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:43163353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,A7,B7,C35
`Chr5:43163390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,C26,C33,C84
`Chr5:43164202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C15,C52,C84
`Chr5:43164519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B93
`Chr5:43164547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A7,B7,B75,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810142.1

437 aa

218

437

Aa_trans

Trp_Tyr_perm

PF01490 Aa_trans 26-421 aa PF03222 Trp_Tyr_perm 28-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810142.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	26	421	8.4e-98	328.4	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057810142.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	28	141	4.5e-05	23.5	Tryptophan/tyrosine permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954159.1
TTAGTTGATGCAACTCAAATTATTAGGAGAAAATAAAAAGTAGGCCAATAAGGTGTCATGTGTCAACTTTTGGCCATACTAGTATAAGTGATGAGCCGCTACAAATACATGATGATACGCACTTCACACTTCCATTGCAAAAATGGTTTCATCTTCTCCCCCACAATCTAAAGAAATTCCATCAGATGAGAAATGGGTAGAAGAGGGCAGCCGGCGTAACGCAAAATGGTGGTATTCCACTTTCCACACCGTGACGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024652
ATGGTTTCATCTTCTCCCCCACAATCTAAAGAAATTCCATCAGATGAGAAATGGGTAGAAGAGGGCAGCCGGCGTAACGCAAAATGGTGGTATTCCACTTTCCACACCGTGACGGCCATGGTCGGCGCCGGCGTTCTGAGCCTGCCGTACGCCATGGCCTACTTAGGATGGGGAGGTGGAACATTTGTGATGGCCCTGTCATGGTGCGTGACCCTCCACACCATGTGGCAGATGACGCAGCTCCACGAGTGCGTCCCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810142.1
MVSSSPPQSKEIPSDEKWVEEGSRRNAKWWYSTFHTVTAMVGAGVLSLPYAMAYLGWGGGTFVMALSWCVTLHTMWQMTQLHECVPGVRFDRYYDLGRHAFGPRLGPWIVLPQQLIVQVGCDIVYMVTGGKCLKNFMQIACAHCTPIRQSYWICIFGGLHFFLSQLPDFHSVSAVSLAAAIMSLCYSSIAWAGSLAKGRAPDVSYGYKKTSGVDAMFRVFNALGQITFAYAGHAVALEIQATIPSTPEMPSRVPMWKGAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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