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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003298`

染色体: Chr05 坐标: 43182071-43183802 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003298`
名称	SmilChr05G003298
描述	uncharacterized SmilChr05G003298
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43182071 - 43183802 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025959`
GeneID	`131025959`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025959`
原始查询	`SmilChr05G003298`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=23.8; qcov=0.814; evalue=1.43e-23; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.7; qcov=0.701; evalue=1.54e-32; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025959

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811722.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811722.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811722.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811722.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43182077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B10,B25,C61,C62,C81
`Chr5:43182077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B25,C61,C62,C81
`Chr5:43182083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr5:43182121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B35
`Chr5:43182165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B91
`Chr5:43182286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr5:43182830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C16
`Chr5:43182845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr5:43182856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:43182866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A10,A14,A19,A4,A9,B108,B111,B123,B130,B131,B140,B16,B22,B29,B37,B44,B52,B54,B58,B65,B75,B97,C10,C17,C29,C36,C39,C53,C54,C56,C63,C74,C81,C87,D10,D2,D8
`Chr5:43182894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:43182899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,C34,C63,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811722.1

408 aa

204

408

SWIM

PF04434 SWIM 265-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811722.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	265	297	0.00045	20.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955739.1
ATGAAGCAAGGGGCTGAGGCAAAAGTTGGACGCTCAGATCAGGGACGCCTCTATTACAAGTGCAAGCACTCTGATAAGTGCAAGTTCGATGTGCGTGCATCTTGTCACGGCGGAGGGATGTGGGGAGTGCATAAGTTTAAAGAGCACTCTTGCCAAGAAGAATTGAGCATTTTGAAACGAATAAAGGCACATTCGAATGTGGTTGCAGCTTATGTGGAAAAAAGAATACGCGATGACGGAGAGCCCGACAACTTACTAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025959
ATGAAGCAAGGGGCTGAGGCAAAAGTTGGACGCTCAGATCAGGGACGCCTCTATTACAAGTGCAAGCACTCTGATAAGTGCAAGTTCGATGTGCGTGCATCTTGTCACGGCGGAGGGATGTGGGGAGTGCATAAGTTTAAAGAGCACTCTTGCCAAGAAGAATTGAGCATTTTGAAACGAATAAAGGCACATTCGAATGTGGTTGCAGCTTATGTGGAAAAAAGAATACGCGATGACGGAGAGCCCGACAACTTACTAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811722.1
MKQGAEAKVGRSDQGRLYYKCKHSDKCKFDVRASCHGGGMWGVHKFKEHSCQEELSILKRIKAHSNVVAAYVEKRIRDDGEPDNLLVVSDAHVSIGNVVKSELPNATHGLCYYHLQNKIKGYGQAVVELFRQAAYAYEDSEFSRAMLAMAQLKPATYGKLMRVGPEKWARSKSLVTRYSFLISNAVEALNARLLWARRLPICSMLEAIRMVLEQWFNDRLASAEESNDLFTPEATQKMSAEISKSRRYTAKRTSERKYRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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