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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003305`

染色体: Chr05 坐标: 43319960-43321534 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003305`
名称	SmilChr05G003305
描述	uncharacterized SmilChr05G003305
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43319960 - 43321534 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024656`
GeneID	`131024656`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024656`
原始查询	`SmilChr05G003305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT1G13480; symbol=AT1G13480; hit=AT1G13480; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT1G13480; symbol=AT1G13480; hit=AT1G13480; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G13480` (AT1G13480) - identity=44.2; qcov=1.04; evalue=3.4e-102; confidence=medium
Rice	`Os08g0413100` (OSJNBa0007M04.25) - identity=40; qcov=1.1; evalue=8.92e-94; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06880 (DUF1262)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024656

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810147.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810147.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057810147.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810147.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43320353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:43320362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:43320429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B131,C74
`Chr5:43320429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C74
`Chr5:43320443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:43320447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:43320450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr5:43320465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C15,C52,C84
`Chr5:43320498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:43320518`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B127,D2
`Chr5:43320518`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:43320523`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A11,A3,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810147.1

378 aa

189

378

DUF1262

PF06880 DUF1262 22-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810147.1`	Pfam	`PF06880`	DUF1262	Family	22	122	5.7e-36	123.6	Protein of unknown function (DUF1262)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954164.1
GAGTCAGATCTGAGACGTGCGTTGTCGTAAGGAGGCAATTCATCCGAAATTGCAAACTAATAAAGCAAAGAAATGTCAAAGCTATTACAGATAAGATAATAGTAATAAATATGCATCCGATCTCCATCCGAGGAAGACAAATATCTGAAGAAAAAGAAGAAGAATGTACGTGACAAGGCCTCTGTCGCAGCTGCTAAAATCCCCAGAAATTTTAGCAGCAGCTCCCGACGGTCCCAACAGTGGATTCCTAGTGATCCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024656
ATGTACGTGACAAGGCCTCTGTCGCAGCTGCTAAAATCCCCAGAAATTTTAGCAGCAGCTCCCGACGGTCCCAACAGTGGATTCCTAGTGATCCAAGACGAGGAATCTTTGAGATACTCTTGTTTCGGAGTGTGCAAGAATCGCAGCCTTAAGCAGCTGCCTTTCCCTCAAGACAAGGAGCTCACCATTCAATACACCACCAGCAACGGCCAGTCCACTCATGTATCCAACGATCCTGTTTTCTTGATTCCTGCTCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810147.1
MYVTRPLSQLLKSPEILAAAPDGPNSGFLVIQDEESLRYSCFGVCKNRSLKQLPFPQDKELTIQYTTSNGQSTHVSNDPVFLIPALNCPLSSNRYYAILPHRKRIGEAFTCSREEDKVSCCFCRCVKDVKSRPLDPRNVYQQFQLVPYESACISAGYFVAKSVASDGFPPYFLRRKGWTIYTKTPHTFKLDTAQGLDPGLRARLPELDSSRVVGKWYTPFVFVKDGSLRDQVKRSMYYEVTLEQRWEQIFKIGRDHNIGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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