当前解析结果
SmilChr05G003311| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003311 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003311 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003311 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 43377036 - 43380032 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024662 |
|---|---|
| GeneID | 131024662 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024662 |
| 原始查询 | SmilChr05G003311 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024662 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810155.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057810155.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057810155.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810155.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810155.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:43377135 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C34 |
Chr5:43377135 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C34 |
Chr5:43377226 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr5:43377248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,C62,C78 |
Chr5:43377251 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,C62,C78 |
Chr5:43377268 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B134,B138,C3,C8 |
Chr5:43377306 |
ACC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 19 | A18,B120,B41,B60,B63,B78,B8,B82,B85,B86,B91,C1,C18,C23,C29,C37,C43,C76,D1 |
Chr5:43377327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr5:43377384 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,B7,C1 |
Chr5:43377385 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr5:43377422 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B137 |
Chr5:43377422 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。