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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003321`

染色体: Chr05 坐标: 43508425-43509017 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003321`
名称	SmilChr05G003321
描述	dirigent protein 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43508425 - 43509017 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024670`
GeneID	`131024670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024670`
原始查询	`SmilChr05G003321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 5-like
产物	dirigent protein 5-like
Arabidopsis	`AT1G64160` (DIR5) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842720] identity=60.2; qcov=0.885; evalue=8.9e-69; confidence=high
Rice	`Os07g0637700` - identity=50.5; qcov=1.07; evalue=2.33e-54; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057810163.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057810163.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810163.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810163.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810163.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43508535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	161	A10,A11,A14,A15,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B108,B109,B11,B112,B114,B115,B119,B12,B120,B123,B124,B126,B127,B129,B13,B131,B135,B140,B15,B16,B19,B20,B22,B24,B25,B26,B28,B33,B34,B37,B38,B39,B4,B41,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B57,B58,B6,B61,B62,B63,B64,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B77,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B99,C1,C10,C11,C12,C15,C17,C18,C19,C22,C23,C26,C27,C29,C32,C33,C35,C36,C38,C4,C40,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C52,C53,C54,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D2,D3,D8,D9
`Chr5:43508576`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	45	A22,A5,B100,B105,B120,B123,B124,B129,B140,B16,B20,B22,B25,B34,B49,B50,B52,B57,B61,B62,B69,B86,B90,B91,B92,B95,B99,C17,C23,C35,C36,C38,C46,C47,C53,C59,C6,C60,C63,C67,C70,C74,C81,C83,D9
`Chr5:43508586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,D10
`Chr5:43508587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:43508624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:43508632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:43508674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B62
`Chr5:43508727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B139,B85,B99,C22,C53
`Chr5:43508727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B85,B99,C22,C53
`Chr5:43508751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr5:43508820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810163.1

182 aa

182

Dirigent

PF03018 Dirigent 33-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810163.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	33	174	2.4e-37	128.7	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954180.1
TCAATTCAAACATGAACAATCCTATTCCAAAATCGTGTTTCATCTTCCTGTCTCTCCTCGCACTAAGTCTAAGTGTAACGCACGGCAGAAGCACGAGGCTCGAGCCATGCAAAAGAATCGTGCTATACTACCACGACATACTCTTCAACGGCACCGACGCCGCCAACGCGACGTCAGTGAACATCACCAGCCCGTCGGCCATCAGCAAATTCGAATTTGGCATGATGGTGGTCTTCGACGACCCGATGACAGAGGACGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024670
ATGAACAATCCTATTCCAAAATCGTGTTTCATCTTCCTGTCTCTCCTCGCACTAAGTCTAAGTGTAACGCACGGCAGAAGCACGAGGCTCGAGCCATGCAAAAGAATCGTGCTATACTACCACGACATACTCTTCAACGGCACCGACGCCGCCAACGCGACGTCAGTGAACATCACCAGCCCGTCGGCCATCAGCAAATTCGAATTTGGCATGATGGTGGTCTTCGACGACCCGATGACAGAGGACGGACGCCTCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810163.1
MNNPIPKSCFIFLSLLALSLSVTHGRSTRLEPCKRIVLYYHDILFNGTDAANATSVNITSPSAISKFEFGMMVVFDDPMTEDGRLLSPAVARAQGFYVYDKKDGYSAWFAYTLLFNSTDYKGTLNVIGSDPFPQETRDLSVVGGTGDFFMARGIVTFQTDDAQGDFYFRLKMDIKLYECYKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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