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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003328`

染色体: Chr05 坐标: 43633233-43634987 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003328`
名称	SmilChr05G003328
描述	uncharacterized SmilChr05G003328
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43633233 - 43634987 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024676`
GeneID	`131024676`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024676`
原始查询	`SmilChr05G003328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0221900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0221900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0221900` - identity=42.5; qcov=0.249; evalue=1.07e-22; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03417 (AAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024676

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810172.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810172.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810172.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810172.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43633486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr5:43633703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:43633706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C24,C3,C44
`Chr5:43633723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D4
`Chr5:43633990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B75
`Chr5:43634200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:43634485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C86,D11
`Chr5:43634503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C4
`Chr5:43634713`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B42,B43
`Chr5:43634713`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810172.1

350 aa

175

350

AAT

PF03417 AAT 123-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810172.1`	Pfam	`PF03417`	AAT	Domain	123	339	1.4e-26	94.3	Acyl-coenzyme A:6-aminopenicillanic acid acyl-transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954189.1
GCTAGGGGTTAAATAGACACGAGTTTAGTAGGAAGATAAGGTAGTAAGCAAGAAGGTTGAGCAAGAGAGATAAAAATTGGCGTTGAAAAAGAAGATGGAATCGAAAAGGCTGGAAATGTTTGAAGTTGGTCCGTGCAAAGATGGATTTGAGATGGGTTTTCTGATCGGTGAAAGATTCTCGAGCATGATCAAAAGCAGGCTTGAAAACGATGTAATTCTGCAGAAGCAGATGCTCCCATTTGCAGAGTCTCCACATTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024676
ATGGAATCGAAAAGGCTGGAAATGTTTGAAGTTGGTCCGTGCAAAGATGGATTTGAGATGGGTTTTCTGATCGGTGAAAGATTCTCGAGCATGATCAAAAGCAGGCTTGAAAACGATGTAATTCTGCAGAAGCAGATGCTCCCATTTGCAGAGTCTCCACATTCAAACCCACTCCTCACATCCCTCTCCCAAACCAATAAGAAAAAGTACCCCATCTACTGGGATGAGCTCAAAGGAACTGCTCAAGGAAGCGGCGCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810172.1
MESKRLEMFEVGPCKDGFEMGFLIGERFSSMIKSRLENDVILQKQMLPFAESPHSNPLLTSLSQTNKKKYPIYWDELKGTAQGSGAPFLHIMLLNFRKEILPFIPKADATNDDCTDILVVAESMAVAAHNEDANVALLGHTYLIKGNLESGASFTAYTYAGELPTCAFGFNTHGLAFTLNSVPPTRHEIAAGGIGRNFISRDLLQAQNLDDALARLYTSEASVGHSYNLIDVNTRRILNVETASRNRCSVHEVGSLPFFH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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