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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003331`

染色体: Chr05 坐标: 43699371-43700654 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003331`
名称	SmilChr05G003331
描述	uncharacterized SmilChr05G003331
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43699371 - 43700654 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024679`
GeneID	`131024679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024679`
原始查询	`SmilChr05G003331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF1191) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828472]; symbol=AT4G23720; hit=AT4G23720; species=arabidopsis; confidence=low
产物	transmembrane protein, putative (DUF1191) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828472]; symbol=AT4G23720; hit=AT4G23720; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G23720` (AT4G23720) transmembrane protein, putative (DUF1191) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828472] identity=34.3; qcov=1.08; evalue=5.48e-48; confidence=low
Rice	`Os11g0118600` - identity=36.3; qcov=0.983; evalue=7.72e-46; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06697 (DUF1191)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810175.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810175.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810175.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810175.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43699834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:43700004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:43700037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B110,C60,C62,C82
`Chr5:43700252`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr5:43700252`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr5:43700360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810175.1

289 aa

144

289

DUF1191

PF06697 DUF1191 25-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810175.1`	Pfam	`PF06697`	DUF1191	Family	25	203	2e-59	201.1	Protein of unknown function (DUF1191)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954192.1
TAATCAACTACCAAATTAACTTTTGTAATTTCAAATTGATCTTCCATTGATTCAGCACCAAAATGGACCAAAAAGCAACAGCAGCATGCGCTACACCTCACTCTTCACTATCATTACACACCTCTACTTAGGAGACCATATAATTAACTTGGGTCCATTTTTGACTTATGAAAGGTTAACTTCTTCACCATAAAAAGAATATATTCAACACACAAAATTCAGACAAACTCCCTCATGGGACAGAAGAAAAGCAATCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024679
ATGGGACAGAAGAAAAGCAATCTCTGCTTCATCTTGTTGTTGCAGTTCACCTCTTTGATCCACTGCTTTGCTGAACCTTTGGACACCATTCTTCATGACCATGCTCTGAGAGTGATGAGTCAGAAGCGACGGCACTCAGACGAGCTCTACGACGCTAGGCTCCCTAAATATCTAGCTGGGATGAAGCTTTCTGTGGTAGGGCTCAGAAGCAGAACCCTATGGACAAAAGGAGCCAATTTCAGCAGCTTCCTCATTCCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810175.1
MGQKKSNLCFILLLQFTSLIHCFAEPLDTILHDHALRVMSQKRRHSDELYDARLPKYLAGMKLSVVGLRSRTLWTKGANFSSFLIPPKTLPVPYVKRILIVYHNLGNCSSSYYSLSGYSLLTPVVGFLVYDASHLSSKNLSKLELNTNGETISIAFNKSLSARGKEGTKCAAFGALGDVLLSDLSLPNICHSTSQGHFSIVIPIKKRHKMSLLWILGFVAGFTGLVLGTVAVRSLLCKRTQEMEREADEGEFLKTYWIAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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