当前解析结果
SmilChr05G003349| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003349 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003349 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003349 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 44201373 - 44201921 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025975 |
|---|---|
| GeneID | 131025975 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025975 |
| 原始查询 | SmilChr05G003349 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01107 (MP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025975 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811739.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057811739.1 |
| 3 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 0.20000 | XP_057811739.1 |
| 4 | Autophagic vesicle | Autophagic vesicle | 0.20000 | XP_057811739.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811739.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:44201402 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A16,B21 |
Chr5:44201452 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B12,B2,B76,C73 |
Chr5:44201467 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr5:44201469 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A15,A16,B132,B21,B79,C53,C68,C9 |
Chr5:44201480 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,A16,B21 |
Chr5:44201504 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr5:44201516 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,C76 |
Chr5:44201519 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,C60,C62,C82 |
Chr5:44201531 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,C53,C9 |
Chr5:44201550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,C68 |
Chr5:44201575 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr5:44201583 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057811739.1PF01107
MP 72-176 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057811739.1 |
Pfam | PF01107 |
MP | Family | 72 | 176 | 1.7e-18 | 67.6 | Viral movement protein (MP) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。