当前解析结果
SmilChr05G003350| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003350 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003350 |
| 描述 | protein CROWDED NUCLEI 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 44221424 - 44224741 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024689 |
|---|---|
| GeneID | 131024689 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024689 |
| 原始查询 | SmilChr05G003350 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein CROWDED NUCLEI 1-like |
| 产物 | protein CROWDED NUCLEI 1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024689 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810193.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057810193.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057810193.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057810196.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810193.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:44222007 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,C53,C9 |
Chr5:44222090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,B28,C41 |
Chr5:44222136 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr5:44222196 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 22 | A20,A4,A7,A8,B114,B118,B12,B126,B19,B53,B63,B67,B73,C15,C33,C34,C54,C57,C70,C73,C78,C84 |
Chr5:44222311 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 44 | A23,A4,B106,B125,B129,B133,B136,B137,B16,B20,B25,B3,B30,B31,B32,B42,B43,B49,B50,B51,B55,B58,B69,B70,B79,B85,B94,B97,C10,C17,C20,C23,C27,C31,C36,C41,C46,C58,C63,C7,C72,C74,C79,C81 |
Chr5:44222362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr5:44222374 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr5:44222416 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,C76 |
Chr5:44222878 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B101,B118,B131,B77,C17,C23,C24,C3,D10 |
Chr5:44222895 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
Chr5:44223795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr5:44223961 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。