当前解析结果
SmilChr05G003354| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003354 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003354 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003354 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 44289644 - 44298765 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024692 |
|---|---|
| GeneID | 131024692 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024692 |
| 原始查询 | SmilChr05G003354 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024692 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810199.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057810199.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057810199.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057810199.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810199.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:44290016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C15,C50 |
Chr5:44290170 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr5:44290183 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B47 |
Chr5:44290198 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B47,C68 |
Chr5:44290200 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,A21 |
Chr5:44290228 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A20,B137,B33,B35,B41,C36,C82 |
Chr5:44290257 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 19 | A19,B106,B109,B118,B126,B13,B20,B30,B35,B7,B76,B78,B86,B90,C25,C34,C41,C60,D2 |
Chr5:44290259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 45 | A15,A16,A24,A7,B100,B102,B105,B112,B113,B114,B12,B125,B136,B139,B26,B3,B36,B38,B39,B4,B42,B43,B61,B63,B70,B71,B72,B77,B81,B82,B9,B97,C14,C20,C30,C33,C39,C40,C42,C52,C56,C62,C63,C82,C83 |
Chr5:44290266 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr5:44290267 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C21,C5 |
Chr5:44290276 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr5:44290277 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。