Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003365`

染色体: Chr05 坐标: 44489133-44490637 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003365`
名称	SmilChr05G003365
描述	uncharacterized SmilChr05G003365
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44489133 - 44490637 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024698`
GeneID	`131024698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024698`
原始查询	`SmilChr05G003365`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810215.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810215.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810215.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810215.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44489601`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B17,B24,B69,B7,B83,B9,C11,C15,C52,C69,C84
`Chr5:44489602`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	116	A1,A16,A23,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B106,B108,B113,B12,B120,B122,B124,B129,B132,B134,B138,B14,B140,B16,B2,B20,B21,B25,B28,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B41,B44,B49,B5,B50,B51,B52,B55,B57,B58,B59,B60,B64,B65,B66,B70,B72,B74,B76,B79,B8,B82,B85,B86,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C23,C24,C27,C29,C3,C32,C34,C36,C39,C41,C42,C43,C46,C47,C53,C55,C57,C58,C59,C63,C68,C7,C70,C74,C75,C76,C79,C8,C81,C83,C87,C9,D1,D3
`Chr5:44489652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B122,B50,C41
`Chr5:44490226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:44490289`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B38,B39
`Chr5:44490289`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:44490375`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	63	A1,A10,A14,A16,A19,A6,B1,B104,B109,B111,B113,B12,B123,B124,B129,B14,B140,B2,B21,B30,B33,B36,B37,B38,B45,B5,B57,B59,B64,B66,B68,B71,B72,B76,B81,B88,B90,B92,B93,B99,C16,C17,C19,C20,C21,C24,C27,C32,C42,C46,C47,C48,C53,C55,C68,C70,C73,C75,C79,C86,C87,D4,D6
`Chr5:44490416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B37,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954233.1
AAAACTTCAATATTCGATCTACGAGGTTGAAGATGCTCGAAATCGGTAGATACCATGGGTGGGTTTCTACCTTAAAGGCAGAGGCAGAGCTGAGAATTTGGGCTCCTAATCTAATTTCAGCTTATGTTTGTGGGTAGTTGTTTGCTATATGTCCCTTCTTTGGCTACTGCAAATCTTTCTTTTGATTATTTATATGATGAATTAGATCAAATTGATTGTGAGGACATGGCGCCCCTTTAAACTGTTCCATCAAGTTTTTC...

XM_057954232.1
AAAACTTCAATATTCGATCTACGAGGTTGAAGATGCTCGAAATCGGTAGATACCATGGGTGGGTTTCTACCTTAAAGGCAGAGGCAGAGCTGAGAATTTGGGCTCCTAATCTAATTTCAGCTTATGTTTGTGGGTAGTTGTTTGCTATATGTCCCTTCTTTGGCTACTGCAAATCTTTCTTTTGATTATTTATATGATGAATTAGATCAAATTGATTGTGAGGACATGGCGCCCCTTTAAACTGTTCCATCAAGTTTTTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131024698
ATGAAGGAGAACGACATGCATGTTCAATTCCCGAATGCTGAGTTTCTTGAACTAGAATTTTATGACTGCCGGATGCTTGATGTTGTTGTTCTTGACATGTTTCCTAAGCTGAAGACGTTAACTGTTTATCAGGCTAATAATACATTGCAGGGTCATCGTTTTACCTATTATGATGAAGAGGTTGTTCACATTACTATGGTTGATGCATGTAATTCATTGGCGTCTGCTAAGATGACTTCTCCCAGTCCCTCTCTTCTCCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057810215.1
MKENDMHVQFPNAEFLELEFYDCRMLDVVVLDMFPKLKTLTVYQANNTLQGHRFTYYDEEVVHITMVDACNSLASAKMTSPSPSLLHLKTFEFTLSMCDPSIIPAIQILLENAPILERVVIRLRQQASDVETFLFAQEKVLSMPRSSPTAQVIISLIDT

XP_057810216.1
MKENDMHVQFPNAEFLELEFYDCRMLDVVVLDMFPKLKTLTVYQANNTLQGHRFTYYDEEVVHITMVDACNSLASAKMTSPSPSLLHLKTFEFTLSMCDPSIIPAIQILLENAPILERVVIRLRQQASDVETFLFAQEKVLSMPRSSPTAQVIISLIDT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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