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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003366`

染色体: Chr05 坐标: 44491102-44492535 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003366`
名称	SmilChr05G003366
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44491102 - 44492535 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025982`
GeneID	`131025982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025982`
原始查询	`SmilChr05G003366`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=31.4; qcov=0.648; evalue=1.57e-23; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=31.6; qcov=0.65; evalue=1.79e-26; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057811746.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811746.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811746.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811746.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44491119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C86
`Chr5:44491126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A4,B106,B120,B129,B16,B20,B25,B49,B50,B51,B55,B58,B70,B85,B94,B97,C10,C14,C17,C23,C27,C36,C41,C46,C58,C63,C7,C74,C79,C81
`Chr5:44491189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:44491222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:44491260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:44491341`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B102,B125,B136,B18,B6,C14,C63
`Chr5:44491342`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A21,B118,B131,B135,B137,B138,B15,B2,B27,B28,B3,B47,B59,B60,B74,B77,B78,B84,B89,C2,C25,C26,C45,C5,C50,C51,C56,C62,C65,C77,C85,D10,D6,D7
`Chr5:44491357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C46,C84
`Chr5:44491372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B59,C46,C6,C84
`Chr5:44491400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:44491407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B46,B53
`Chr5:44491434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C86,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811746.1

477 aa

238

477

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 174-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811746.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	174	321	7.2e-24	85.0	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955763.1
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCACCGTATTCCACAATCGTCTTGCATTTCTCTCGTTTCACCCTCTCCACAAATCTTGCAACCTGCCTACGAAGAGATGGATCGATTGCAGAGTGTTCTGCTAAAATTAGACGACACCGGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTGCGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATGTCTTACATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025982
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCACCGTATTCCACAATCGTCTTGCATTTCTCTCGTTTCACCCTCTCCACAAATCTTGCAACCTGCCTACGAAGAGATGGATCGATTGCAGAGTGTTCTGCTAAAATTAGACGACACCGGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTGCGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATGTCTTACATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811746.1
MAAYGAATSLKNTIHRIPQSSCISLVSPSPQILQPAYEEMDRLQSVLLKLDDTGCSKIRTKVNAADERIKEAVWEFEDLLESHVLHQILQQLESERDNLSFSVDLQSLQHRVDCFVEMVKMMDEEYIIEMENMPEEEGEPISSRIDFGGIKPKMVGLSDEFQKARDDLLKDKNYSIMGMAGIGKTTLARHIFEDPSIQSHFEFRAWVRVGRKCESNELLRCVLAQVDSNAYQNLTQGDDDVAELVRILKESLKDKKCLIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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