当前解析结果
SmilChr05G003374| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003374 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003374 |
| 描述 | COP1-interactive protein 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 44647786 - 44650892 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025444 |
|---|---|
| GeneID | 131025444 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025444 |
| 原始查询 | SmilChr05G003374 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | COP1-interactive protein 1 |
| 产物 | COP1-interactive protein 1 |
| Arabidopsis | AT5G41780 (AT5G41780)myosin heavy chain-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834183] identity=26.4; qcov=0.992; evalue=1.16e-29; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003779 (actin binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025444 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057811210.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057811210.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.20000 | XP_057811210.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057811210.1 |
| 5 | Spindle pole body | Spindle pole body | 0.20000 | XP_057811210.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:44648699 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,B38,B39 |
Chr5:44649248 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 69 | A1,A13,A16,A18,A6,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B11,B110,B112,B113,B124,B13,B132,B14,B16,B17,B22,B30,B33,B38,B39,B4,B40,B47,B5,B57,B59,B6,B62,B67,B72,B74,B76,B80,B84,B90,B92,B95,C16,C19,C20,C21,C24,C28,C32,C39,C42,C47,C52,C53,C55,C56,C59,C6,C67,C68,C7,C70,C75,C79,C83,C9 |
Chr5:44649348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,B75,C76 |
Chr5:44649508 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B21,B68,C35,C48 |
Chr5:44649579 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C5 |
Chr5:44649579 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr5:44649673 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr5:44649804 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr5:44649822 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B125,B18,B6,C14,C63 |
Chr5:44649898 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B21,C35,C48 |
Chr5:44650053 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr5:44650302 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。