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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003377`

染色体: Chr05 坐标: 44665944-44677322 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003377`
名称	SmilChr05G003377
描述	COP1-interactive protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44665944 - 44677322 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024818`
GeneID	`131024818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024818`
原始查询	`SmilChr05G003377`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP1-interactive protein 1
产物	COP1-interactive protein 1
Arabidopsis	`AT5G41790` (CIP1) COP1-interactive protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834184] identity=32.9; qcov=0.857; evalue=3.91e-142; confidence=low
Rice	`Os01g0656600` - identity=26.6; qcov=0.134; evalue=2.08e-11; confidence=weak
GO	GO:0003779 (actin binding)
KEGG	-
Pfam	PF07765 (KIP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810340.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810340.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057810340.1`
4	Phragmoplast	Phragmoplast	0.20000	`XP_057810340.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44671712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:44671991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B30,B31
`Chr5:44672115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B80,C53,C9
`Chr5:44672293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B18,B6,C14,C63
`Chr5:44672516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B22
`Chr5:44672557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:44672600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:44672666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C55,C71
`Chr5:44672764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B18,B6,C14,C63
`Chr5:44673082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:44673275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,C3,C8
`Chr5:44673445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810340.1

1820 aa

910

1820

KIP1

PF07765 KIP1 14-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810340.1`	Pfam	`PF07765`	KIP1	Family	14	72	2.6e-08	34.6	KIP1-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954357.1
TACTAGCAGACAAATTCACTTTTCCTCTCTCTCGCTCTCTCAAAAAGAAGGAGATTTATTAATATTCCTCCATTTTATTTTTCCCTCTGATTTTGCCAACTAGCACACCATTGGATTCTCCTATTCAAATTTAAATAATTTCTCACTCACAAACACACACCTCTCTCTCTCTCCCTCCCTCCATATCCCTCTCTCTTTCTAAAAGTTTTGGTGATTTCACAGTCAGCTGAGGCTGCCAATGCAGGAAAGTTGATTTTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024818
ATGCCCAAGCATCGGTGGCGCGAATCGGTGAAAACCTTTTTTGGGAATCATGTTGATCTTGAAAGAAATCAGGAGCTGAAAGAAACCAAAGCAGAAATCGAGGGCAACGTGCAGAAGATCTTAAAGGTTCTTAAAGAAGATGATGAGAAGGAACCACTGGCTAATCTTGTTGAGGATTTCCACAATCACTACCAGTCTCTATACGCGCGTTATGATAATCTGACGGAAGAGTTGAGGGAAAAGGCGAACAAAAAACATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810340.1
MPKHRWRESVKTFFGNHVDLERNQELKETKAEIEGNVQKILKVLKEDDEKEPLANLVEDFHNHYQSLYARYDNLTEELREKANKKHGKGGSSSSSDSSDSDDSHRGERGSKNGVDEHEKAAAVKQELEMALSEIADSKRKLAITVYEKETLHQEYQNALNKTKESETIIAELNSKAEKLEGENSRLLAENTDVKLELENSVKLQAELNQKLEEMKSEREILSIEKDAAAAKLEEEKDTADELRTINNQLHKEREAIQLEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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