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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003389`

染色体: Chr05 坐标: 44924306-44925993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003389`
名称	SmilChr05G003389
描述	probable WRKY transcription factor 41
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44924306 - 44925993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024486`
GeneID	`131024486`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024486`
原始查询	`SmilChr05G003389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 41
产物	probable WRKY transcription factor 41
Arabidopsis	`AT4G11070` (WRKY41) WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826708] identity=39.3; qcov=1.01; evalue=7.76e-66; confidence=medium
Rice	`Os08g0386200` (OsWRKY69) - identity=38.8; qcov=0.676; evalue=1.95e-41; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024486

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809977.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809977.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809977.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809977.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809977.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44924599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B31
`Chr5:44924984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B122,B37,C38,D11
`Chr5:44925239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C38
`Chr5:44925266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:44925305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C44
`Chr5:44925376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C44
`Chr5:44925414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:44925518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr5:44925523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr5:44925526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:44925546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:44925613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809977.1

343 aa

172

343

WRKY

PF03106 WRKY 126-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809977.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	126	186	2.5e-27	95.5	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953994.1
ATATAAACCTCTATTTATAATCAAATGACCTCACATTCATCCTCAACAAACCCTAGCCTGCTCACATTCCATTCCTCATAACAGATTTAACTGAATCCAACTTATCTCTAACACATATATGAAAGCATTCCGCTTGCATTGCATAGATCTATCAGTGTTGAAGCAAATCAGCATTTGATCGAATATGGAGAGCGCGTGTAGCTTGGAATACAAGACGGTGATCAACGAGCTCGTGCAGGGCATGGAGAAAGCCAAGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024486
ATGGAGAGCGCGTGTAGCTTGGAATACAAGACGGTGATCAACGAGCTCGTGCAGGGCATGGAGAAAGCCAAGCAGCTCCATTCCCATCTCTGCTCCACGTCCCCGTCTCGAGCTCAGGACCTGCTCATGCAGAGGATCCTATCCTCGTACGAGAAGGCCTTGCTCATCCTCAACCCCAAGGAACACACTCCACCACCCTCGGCAGCCGCTGTCGACTCACCAATATCTGTCGTTGACGGAATCTGCAGAAGTGAGGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809977.1
MESACSLEYKTVINELVQGMEKAKQLHSHLCSTSPSRAQDLLMQRILSSYEKALLILNPKEHTPPPSAAAVDSPISVVDGICRSEDLNNSFRDNQDYNASKKRKMQPTWMEQVKVNPENGLEGPADDGYSWRKYGQKDILGARYPRSYYRCTYRLVQNCWATKQVQRSDDDPTVFEITYKGTHTCNQSTNAPVVPPPVSQEKQELQQQSQALLKLKASLRVNTDTGNSETMPAHFSFPSTYELCDTDNHYISFSDLVGDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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