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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003392`

染色体: Chr05 坐标: 44949967-44952786 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003392`
名称	SmilChr05G003392
描述	uncharacterized SmilChr05G003392
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44949967 - 44952786 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025987`
GeneID	`131025987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025987`
原始查询	`SmilChr05G003392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=34.5; qcov=0.289; evalue=3.19e-23; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811751.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811751.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057811751.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057811751.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057811751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44949967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr5:44949977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B11,B89,C37,C78
`Chr5:44949978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:44949999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B103,B122,B45,B71,C13,C17,C49,C62,C68
`Chr5:44950002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:44950005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B138,B47,B58,B66,B90,C30,C74,C82,D9
`Chr5:44950023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B107,C1
`Chr5:44950031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B60
`Chr5:44950033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:44950037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C60
`Chr5:44950043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B125,B26,B45
`Chr5:44950078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C50,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811751.1

772 aa

386

772

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 267-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811751.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	267	332	2.3e-10	41.4	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955768.1
ATGGGATCCTCTGATGCTCACCGCAACTTGGAGAAGGAGTTCGATTCCGCTGCTATCGCTACCGAGGTGCCTACCTCACTGTTCAATGGCCTTCAGGGTAACCCCACTTTCACTGTGCCACCGGGTTTTCAGGCTATCTCAGCCACTCCGACAACAGGGTTGAACGTCAACACCCAGAGGTTTGCTCTGGTAACACCGGGCTCTGATCTGCCAAACTTGGCCCCCACGTCTGGAGGGGGGTCGCTTAACTTCGGGCTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025987
ATGGGATCCTCTGATGCTCACCGCAACTTGGAGAAGGAGTTCGATTCCGCTGCTATCGCTACCGAGGTGCCTACCTCACTGTTCAATGGCCTTCAGGGTAACCCCACTTTCACTGTGCCACCGGGTTTTCAGGCTATCTCAGCCACTCCGACAACAGGGTTGAACGTCAACACCCAGAGGTTTGCTCTGGTAACACCGGGCTCTGATCTGCCAAACTTGGCCCCCACGTCTGGAGGGGGGTCGCTTAACTTCGGGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811751.1
MGSSDAHRNLEKEFDSAAIATEVPTSLFNGLQGNPTFTVPPGFQAISATPTTGLNVNTQRFALVTPGSDLPNLAPTSGGGSLNFGLAEQMMALLNYANMRQALGTPMLSVIPTAVMPGEMQGNPADRELARPEGSRVRLNSVVRKERLKHQLENLEESLREKSRRDDRGQRSERSYRAEKSHRPEKSRYTERSEERELEYSSGRPEHRAHKRHGHDAPRDRREQGRYKEDKRAKTSRFHPISKRSPFSDDILADTLPRSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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