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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003393`

染色体: Chr05 坐标: 44955976-44972755 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003393`
名称	SmilChr05G003393
描述	uncharacterized SmilChr05G003393
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44955976 - 44972755 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025988`
GeneID	`131025988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025988`
原始查询	`SmilChr05G003393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0271500` - identity=32.5; qcov=0.986; evalue=7.85e-57; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811752.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057811752.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811752.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811752.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44971715`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A1,A13,A24,B111,B113,B128,B137,B18,B22,B24,B26,B36,B57,B61,B7,B72,B78,B79,B86,B88,B99,C16,C22,C23,C25,C34,C37,C39,C40,C43,C59,C66,C71,C74,C85,D3,D5,D7
`Chr5:44971744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C33
`Chr5:44971762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:44971768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:44971769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:44971789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C58,C60,C62,C82
`Chr5:44971845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B90,C87
`Chr5:44971855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B90,C1
`Chr5:44971882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B40,B53,C13,C78
`Chr5:44971914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:44971916`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A10,A25,A5,B109,B111,B121,B130,B15,B37,B43,B51,B52,B7,B82,B88,C11,C15,C29,C34,C35,C39,C46,C52,C69
`Chr5:44972035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,C3,C60,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811752.1

350 aa

175

350

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 5-84 aa PF02992 Transposase_21 291-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811752.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	84	1e-20	74.4	Transposase-associated domain
`XP_057811752.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	291	350	9.4e-24	84.5	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955769.1
GAACCCACTGAAAAGCAGGACGCCATTTCTTCTCGTTGATTTCTCGCTCCCTGCTGCCTGCTTCGATCTTGTTATCCTTATTCAGATCAACTTATAGTTGTGCAGCCGTCAGACTTTGTTGCCATAATCACTTGATTTTGCTGAAAGGTATTTGTTGAAATGAGTGAAAATCGTGAGTGGATGTATAGACGGTTTTTACCCGACGGAGCTTTCAACCCCGCATTCGTTAGAGGTCTTCAAGAATTCATTGATTTTGCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025988
ATGAGTGAAAATCGTGAGTGGATGTATAGACGGTTTTTACCCGACGGAGCTTTCAACCCCGCATTCGTTAGAGGTCTTCAAGAATTCATTGATTTTGCTAACAGTAGAGAAGATTTAATGGATGGACATAAAATTAGATGTCCGTGCAGAAGGTGTGATAATATAAAATTTCATACATCGAGGAATGTCCAATACCATATTTCAAAGAATGGGTTTGTGTTGAATTATCACATTTGGAGGTTTCATGGTGAATTAGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811752.1
MSENREWMYRRFLPDGAFNPAFVRGLQEFIDFANSREDLMDGHKIRCPCRRCDNIKFHTSRNVQYHISKNGFVLNYHIWRFHGELEMMATEYNQFDADDDNEDDQSTYHNMAIDVAASQFNIEQPPNPEAQQLYDMLSDADRELWPGCKTHSQLSLVARLMCLKAEGNMSERCFDQWLELIKEILPEHNLAPNNFYSTKKLLSEMGLPVEKIDCCRNNCMLFWGEDSEDIECKHCNEPRYQQSDTSSACSSRTLVAVKKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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