当前解析结果
SmilChr05G003394| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003394 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003394 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003394 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 44975342 - 44977063 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025989 |
|---|---|
| GeneID | 131025989 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025989 |
| 原始查询 | SmilChr05G003394 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025989 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811753.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811753.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811753.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811753.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057811753.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:44975386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,C13,C78,C83 |
Chr5:44975421 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B59 |
Chr5:44975438 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B8,C33 |
Chr5:44975457 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B8,C33 |
Chr5:44975480 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C16,C53,D5 |
Chr5:44975494 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr5:44975505 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr5:44975524 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B136,B90,C73,C83 |
Chr5:44975529 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr5:44975541 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 19 | A1,A18,A6,B30,B74,B96,B97,C20,C21,C24,C32,C41,C42,C55,C60,C68,C8,C82,D8 |
Chr5:44975570 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A10,A7,A8,A9,B122,B27,B45,B72,B78,B82,C19,C24,C4,C51,C74,C9 |
Chr5:44975657 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。