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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003409`

染色体: Chr05 坐标: 45220073-45226525 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003409`
名称	SmilChr05G003409
描述	mitochondrial inner membrane protein OXA1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45220073 - 45226525 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024501`
GeneID	`131024501`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024501`
原始查询	`SmilChr05G003409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial inner membrane protein OXA1-like
产物	mitochondrial inner membrane protein OXA1-like
Arabidopsis	`AT5G62050` (OXA1) inner membrane OXA1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836325] identity=36.7; qcov=1.06; evalue=2.23e-82; confidence=medium
Rice	`Os10g0521300` - identity=46.4; qcov=0.55; evalue=5.34e-69; confidence=medium
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0032977 (membrane insertase activity); GO:0032979 (protein insertion into mitochondrial inner membrane from matrix); GO:0033617 (mitochondrial respiratory chain complex IV assembly)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02096 (60KD_IMP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024501

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057809991.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057809991.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057809991.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809991.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45220353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:45220409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B27,C33
`Chr5:45220466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,C44,C61,C8
`Chr5:45220514`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B1,B12,B2,B37,B64,B93,C46
`Chr5:45220792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C30
`Chr5:45221298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B44,C44
`Chr5:45224486`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B110,C41
`Chr5:45224486`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B110,C41
`Chr5:45224712`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B119,B126,B127,B131,B24,B38,B39,B68,B72,B73,B96,C35,C70,C86
`Chr5:45224717`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr5:45224717`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr5:45224737`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A16,B1,B126,B130,B136,B139,B26,C13,C21,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809991.1

427 aa

214

427

60KD_IMP

PF02096 60KD_IMP 130-326 aa

XP_057809992.1

427 aa

214

427

60KD_IMP

PF02096 60KD_IMP 130-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809991.1`	Pfam	`PF02096`	60KD_IMP	Domain	130	326	2.2e-26	93.6	60Kd inner membrane protein
`XP_057809992.1`	Pfam	`PF02096`	60KD_IMP	Domain	130	326	2.2e-26	93.6	60Kd inner membrane protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954009.1
TGAAAATGTTGGATGAGCTGCACTCAAACTGGGATTGCAGGTGCAGGCAATCCTTTAATTTTCAGACCCGCACTCCACCTGTCTGATAAAACTCCTGAACCTGCAAAACAAAGTAGAAGAAGAGAAAAAGAACCGAACTGTGCCGCAGCGCACCGCTGCTTTAAAAGCTATCTGAGCAGATCCTCTGGTGTCAAGTCTCGTTGTCGAATGCAACACAGATATCCGTCAAATGCGTGCACTCGCAAAAGACGAACTAGAGA...

XM_057954008.1
TGAAAATGTTGGATGAGCTGCACTCAAACTGGGATTGCAGGTGCAGGCAATCCTTTAATTTTCAGACCCGCACTCCACCTGTCTGATAAAACTCCTGAACCTGCAAAACAAAGTAGAAGAAGAGAAAAAGAACCGAACTGTGCCGCAGCGCACCGCTGCTTTAAAAGCTATCTGAGCAGATCCTCTGGTGTCAAGTCTCGTTGTCGAATGCAACACAGATATCCGTCAAATGCGTGCACTCGCAAAAGACGAACTAGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024501
ATGGCTTTAAGACGGAGCGTCCCTGCACGCGCCAAGTTGTTCTATCAACAGCAACGAGTCGCCGTCCCATTGTCGCATGTCGATCGTGATGATGTCGACCGCGAAAACCTGCCCCGCCATAACCCCATTTACAAGGGCAGTGGGATCCCCGATATTCTGCGGCGCCGCCTCCAGCTCGGGGCCGGAGCAAATGTGGGATGTTTTTATGGGTCGAGGAATCTGTTCCAAGATCGGAGATTTGCGATTCCAGCTGCTTTCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809991.1
MALRRSVPARAKLFYQQQRVAVPLSHVDRDDVDRENLPRHNPIYKGSGIPDILRRRLQLGAGANVGCFYGSRNLFQDRRFAIPAAFSPVSVRKLSTLGDVVEEMVTSEVAAAAADSFRPVAAIQYLTDYVHTLTGLNWWAAIVMTTILYRTLILPFTIRHTIAASKFTLIKPQLDEILKKKKSGVITLAESQALSGKLYKKYDVTPFTPVNGILFGGPVFLCFIFAINNMAVKVQSFKEGGVFWFTDLTTPDAIHILPVL...

XP_057809992.1
MALRRSVPARAKLFYQQQRVAVPLSHVDRDDVDRENLPRHNPIYKGSGIPDILRRRLQLGAGANVGCFYGSRNLFQDRRFAIPAAFSPVSVRKLSTLGDVVEEMVTSEVAAAAADSFRPVAAIQYLTDYVHTLTGLNWWAAIVMTTILYRTLILPFTIRHTIAASKFTLIKPQLDEILKKKKSGVITLAESQALSGKLYKKYDVTPFTPVNGILFGGPVFLCFIFAINNMAVKVQSFKEGGVFWFTDLTTPDAIHILPVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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