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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003416`

染色体: Chr05 坐标: 45380944-45386835 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003416`
名称	SmilChr05G003416
描述	uncharacterized SmilChr05G003416
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45380944 - 45386835 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024507`
GeneID	`131024507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024507`
原始查询	`SmilChr05G003416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=34; qcov=0.752; evalue=1.37e-156; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809998.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809998.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809998.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809998.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45381533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:45381572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B75
`Chr5:45381578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:45381636`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A20,A3,B54,B87,D9
`Chr5:45381636`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A20,A3,B54,B87,D9
`Chr5:45381718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:45381800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B40
`Chr5:45381816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:45381850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B52
`Chr5:45381890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:45381908`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	35	A20,A4,A8,B1,B102,B104,B118,B12,B122,B126,B136,B2,B26,B37,B38,B39,B61,B63,B64,B67,B68,B7,B73,B77,B8,B93,C11,C15,C33,C34,C46,C54,C57,C69,C84
`Chr5:45382275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809998.1

1131 aa

566

1131

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF13963 Transpos_assoc 5-85 aa PF02992 Transposase_21 291-503 aa PF13960 DUF4218 688-795 aa PF13952 DUF4216 972-1048 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809998.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	85	9.9e-20	71.2	Transposase-associated domain
`XP_057809998.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	291	503	1.3e-74	250.7	Transposase family tnp2
`XP_057809998.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	688	795	2.5e-38	131.2	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057809998.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	972	1048	1.7e-20	74.0	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954015.1
ATATGATTAGTAGCACCATTAACAACATACTCCATTAATTTTATGATTACTAGCATCATTGTATTAATTTCAGCTACTTAAATACCATCATTATTCCTCAGCACACGCAGACGTTATTCCGCACTTACTAATAGAAACTTAACTCCGACGGAGTTCATCTGGTGTTATTCCGTCGGTAAATCATGTAATTAGATGCGAAGCCCCTCTCATTTAGTCAAATTCTCCCCCAAATTAGAACTTGCCCTAGGTTCACTTGTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024507
ATGAGTCATAATCGTGAATGGATGTATATTAATCGTTTTCATGATGATGGTGGTTTAAATTCCGATTTTCTAGCTGGACTTGAAACTTTCATTGAGTTTGCTAGTAGTCGATCACTGTTCATGGATGGAAACAATATTAAGTGTCCATGTAAGAAATGTGATAACGTATTTTATAAAGAACCAAACACTGTAAGGTACCACATTGCAAAGTTTGGATTTGTTCAGAATTATTACACTTGGAGATTCCAGGGGGAGACATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809998.1
MSHNREWMYINRFHDDGGLNSDFLAGLETFIEFASSRSLFMDGNNIKCPCKKCDNVFYKEPNTVRYHIAKFGFVQNYYTWRFQGETSVGMADEMNLDVGHKSNVHHTVVTDAHGPLFNMGEPGEKPNPEAQRFYDMLNAANKELWPGCSNHSQLSFMARLMSLKSESTMAEKCSNQILKLVKESVPEDNLVPDDFYSMKKLLHGMGLPVVEIDCCISNCMIYWREDIELVRCKVCGQHRFKSNNRESSSQQKKQVAFKKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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