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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003427`

染色体: Chr05 坐标: 45500515-45501375 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003427`
名称	SmilChr05G003427
描述	uncharacterized SmilChr05G003427
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45500515 - 45501375 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024518`
GeneID	`131024518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024518`
原始查询	`SmilChr05G003427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828493]; symbol=AT4G23930; hit=AT4G23930; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828493]; symbol=AT4G23930; hit=AT4G23930; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G23930` (AT4G23930) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828493] identity=51.1; qcov=1.01; evalue=7.15e-69; confidence=high
Rice	`Os05g0238400` - identity=38; qcov=1.2; evalue=6.83e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810007.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057810007.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057810007.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810007.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45500777`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	99	A1,A13,A15,A18,A23,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B105,B109,B114,B12,B120,B121,B125,B128,B13,B131,B132,B137,B140,B15,B27,B29,B3,B31,B34,B37,B39,B40,B45,B48,B5,B50,B52,B53,B55,B56,B58,B61,B65,B66,B68,B69,B70,B71,B73,B74,B75,B76,B8,B81,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,C12,C13,C19,C2,C20,C21,C26,C28,C35,C36,C47,C5,C54,C56,C6,C63,C64,C65,C7,C70,C73,C74,C76,C80,C81,C82,C85,C86,D10,D11,D6,D9
`Chr5:45500778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B72
`Chr5:45500800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	100	A1,A13,A15,A18,A23,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B105,B109,B114,B12,B120,B121,B125,B128,B13,B131,B132,B137,B139,B140,B15,B27,B29,B3,B31,B34,B37,B39,B40,B45,B48,B5,B50,B52,B53,B55,B56,B58,B61,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B74,B76,B8,B81,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,C12,C13,C19,C2,C20,C21,C26,C28,C35,C36,C47,C5,C54,C55,C6,C63,C64,C65,C7,C70,C73,C74,C76,C80,C81,C82,C85,C86,D10,D11,D6,D9
`Chr5:45500853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:45500854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:45500884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:45500907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:45500926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:45500932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:45500935`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A1,A13,A18,A23,A3,A4,A6,A8,A9,B100,B105,B11,B120,B121,B125,B128,B13,B131,B132,B137,B140,B20,B25,B29,B3,B31,B37,B39,B40,B48,B52,B53,B55,B65,B67,B68,B71,B73,B75,B81,B87,B9,B90,B92,B95,B96,B97,C19,C20,C26,C28,C35,C47,C5,C56,C59,C64,C65,C68,C7,C70,C76,C80,C81,C82,C86,D10,D11,D6
`Chr5:45501010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A1,A13,A23,A3,A4,A8,A9,B100,B120,B128,B131,B140,B29,B3,B37,B39,B52,B53,B55,B65,B67,B68,B71,B73,B81,B87,B90,B92,C19,C20,C35,C47,C64,C65,C68,C7,C70,C76,C80,C81,C86,D6
`Chr5:45501026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954024.1
TGCTTAATCTTAAATGATTCATAACCAAATAGTCCACAATCTAATAAGGGTGACCCCAAATTGGGTGGTGGGTTGATGCCCCCTAAATTCACATCGACGACAAAAATCACGCAAAAGCAATTCAACGAAACACCCCCATTTCACACACACACTCTCTCTCTAAATCTTCATCTTCATCTGGGGAGCTGAGTGACAGTGTATCAATGGGCAAGCCCCCTCCGATCCAGAAACGCCCCAGCGGGCGCACCAACCTGGCGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024518
ATGGGCAAGCCCCCTCCGATCCAGAAACGCCCCAGCGGGCGCACCAACCTGGCGTCGTGCATCGTGGCGACCATCTTCCTCATCTTCGTGGTGATCGTGGCCTGCATCGTCTACTTGACCATCTTCAAGCCCAAGGACCCCAACCTCGCCGTCAACGCCGTCCAGCTCCCGGCCTTCTCCCTCTCCAACTCCACCGTCACCTTCACATTCTCCCAGTACGTCACCCTCAACAACCCCAACCGCGCCGCCTTCTCCCACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810007.1
MGKPPPIQKRPSGRTNLASCIVATIFLIFVVIVACIVYLTIFKPKDPNLAVNAVQLPAFSLSNSTVTFTFSQYVTLNNPNRAAFSHYDSSLQLLHAGRQVGFMFIPAGKIDAGRTQYMAATFSVQSFPLSLPGPTMELESRLEMAGRVRVLHLFNHHVGARADCWVSISLTDGSVLAFHC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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