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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003435`

染色体: Chr05 坐标: 45674089-45675447 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003435`
名称	SmilChr05G003435
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45674089 - 45675447 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025996`
GeneID	`131025996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025996`
原始查询	`SmilChr05G003435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=50.7; qcov=0.314; evalue=5.78e-29; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=44.1; qcov=0.989; evalue=1.23e-127; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811759.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057811759.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811759.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811759.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811759.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45674106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C77,D6
`Chr5:45674124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:45674139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C35
`Chr5:45674147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B71
`Chr5:45674152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D6
`Chr5:45674159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C35
`Chr5:45674160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A10,A14,A19,A2,B10,B109,B111,B123,B129,B2,B22,B29,B36,B51,B66,B69,B76,B83,B84,B88,B95,C17,C27,C53,C76,C86,C9,D11
`Chr5:45674182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:45674183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C35
`Chr5:45674196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B40,D11
`Chr5:45674205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:45674213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811759.1

452 aa

226

452

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 78-117 aa PF04827 Plant_tran 185-388 aa PF13359 DDE_Tnp_4 240-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811759.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	78	117	5.6e-18	65.1	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811759.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	185	388	3.2e-86	288.9	Plant transposon protein
`XP_057811759.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	240	379	1.9e-06	28.3	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955776.1
ATGTCATCATCCACTAATTCTTCAAATCATTCTTCCTCAAATTCTTCATCAGACGAAGAAATTCATGTCGATCCTGCACAACTTCCTCCTCTTCCCGACCCTACTCTACATCCTGATTTATTTTTTATGAGATGTGCTGTGAATTTCATGCAAGTGGCGAGTTCTTATCGTTTCGAGCCTCCTCTGCTACCGAAGAAGAAGCGGAGAGTTGTTTTCCGTGATTGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGTGATTATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025996
ATGTCATCATCCACTAATTCTTCAAATCATTCTTCCTCAAATTCTTCATCAGACGAAGAAATTCATGTCGATCCTGCACAACTTCCTCCTCTTCCCGACCCTACTCTACATCCTGATTTATTTTTTATGAGATGTGCTGTGAATTTCATGCAAGTGGCGAGTTCTTATCGTTTCGAGCCTCCTCTGCTACCGAAGAAGAAGCGGAGAGTTGTTTTCCGTGATTGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGTGATTATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811759.1
MSSSTNSSNHSSSNSSSDEEIHVDPAQLPPLPDPTLHPDLFFMRCAVNFMQVASSYRFEPPLLPKKKRRVVFRDCEGGAERLHRDYFARCPVYGPQFFRRHFRMSRSLFLRIVNALEVDPYFQQRPDACGRFGFSSIQKCTAVIRQLAYDTTADCCDEYLHIGETTALTCLKKFCKVVIHIFSGTYLRRPTTADVQRLTAMHEAKLGFPGMLGSLDCMHWGWKNCLVAWHGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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