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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003441`

染色体: Chr05 坐标: 45781186-45784189 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003441`
名称	SmilChr05G003441
描述	uncharacterized SmilChr05G003441
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45781186 - 45784189 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024531`
GeneID	`131024531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024531`
原始查询	`SmilChr05G003441`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810022.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810022.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810022.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810022.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45781291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B34
`Chr5:45781299`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A25,A4,B11,B120,B129,B130,B136,B16,B3,B48,B49,B50,B52,B55,B85,B94,B97,C10,C12,C17,C23,C28,C33,C36,C44,C46,C5,C58,C63,C7,C74,C79,C8,C81
`Chr5:45781303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:45781311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:45781346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:45781352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr5:45781354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:45781366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6
`Chr5:45781376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B31,B71,B93,C62
`Chr5:45781379`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	121	A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A25,A3,A4,A5,A6,A9,B10,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B113,B117,B123,B125,B126,B127,B128,B132,B133,B134,B136,B137,B14,B140,B16,B18,B19,B2,B21,B24,B26,B28,B31,B32,B34,B35,B36,B4,B40,B42,B43,B49,B50,B52,B53,B60,B61,B63,B65,B66,B68,B70,B71,B72,B73,B74,B78,B80,B83,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B98,C11,C2,C22,C27,C3,C30,C36,C38,C4,C40,C41,C44,C45,C48,C5,C50,C55,C56,C61,C62,C63,C64,C69,C70,C72,C73,C74,C76,C77,C79,C8,C83,C85,C87,C9,D11,D4,D5,D7,D8
`Chr5:45781382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:45781404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B111,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954039.1
GAGGTTCTCTCACCGCGTCACCTCTTCTCTCCCACCGCGTCGCACCGTGTTCTCCCACCGCCGCGCCGCCATCCATTCACCATCATGCACGGAGAAAATCTGAACCCTAACCCATCCGATTCAGTCAGATCGTCGGTGGTTGCTAAAGATTCATTCAGATCGCCCTCTGCTCATCATCACGCCAAGAAGTCATCTGCCAAAAATAATTTGATGAGTAAGCGTCTGATGTTGTTGTTCGAGGATCCATTTCCGATCGTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024531
ATGCACGGAGAAAATCTGAACCCTAACCCATCCGATTCAGTCAGATCGTCGGTGGTTGCTAAAGATTCATTCAGATCGCCCTCTGCTCATCATCACGCCAAGAAGTCATCTGCCAAAAATAATTTGATGAGTAAGCGTCTGATGTTGTTGTTCGAGGATCCATTTCCGATCGTCAAAGCTGTGGAATCAGAAAATCCACCAGAGGTGCCGACCCGGGTCATCGAAATCCCTAATTGCTATGGTGGATGTAAAGATATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810022.1
MHGENLNPNPSDSVRSSVVAKDSFRSPSAHHHAKKSSAKNNLMSKRLMLLFEDPFPIVKAVESENPPEVPTRVIEIPNCYGGCKDIPCVCAEDSIEPSVCEDDTTSWSEELRSIPSLPSMPFSDYNPSDYPVSSEDVYQDLRAFMLRKELLLKLPKVD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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