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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003443`

染色体: Chr05 坐标: 45797168-45797800 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003443`
名称	SmilChr05G003443
描述	uncharacterized SmilChr05G003443
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45797168 - 45797800 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025998`
GeneID	`131025998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025998`
原始查询	`SmilChr05G003443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.6; qcov=0.662; evalue=1.51e-32; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=53.9; qcov=0.919; evalue=1.32e-71; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811762.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811762.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811762.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811762.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811762.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45797183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B103,B11,B135,B15,B41,B53,C51,C85,D10
`Chr5:45797235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr5:45797245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:45797255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:45797262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A25,A4,B106,B11,B129,B130,B136,B16,B20,B3,B48,B52,B55,B70,C10,C17,C23,C27,C36,C44,C46,C5,C63,C74,C79,C8,C81
`Chr5:45797271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,C69
`Chr5:45797307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:45797311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:45797319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr5:45797328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:45797344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:45797371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B68,C35,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811762.1

210 aa

105

210

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 29-68 aa PF04827 Plant_tran 137-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811762.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	29	68	1.2e-19	70.5	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811762.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	210	1.6e-33	116.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955779.1
ATGATCCTAAACAATCATAATCTGATTGTAGGACATCAAATTCCAACAGCCAACAGGAGATATTGTGATAGGGAACGTGAGTTTGGTGCAGAGCATTTGATCAACGACTACTTCAACGACAACCCAACGTATACTCCAGAGCTCTTCCGACGGAAATTTTGCATGCAGAAATCGCTATTCGTTCGAATAGTGGAAGCTGTTACTGCTAATGATGAATTTTTTCAACAGAGACGAGATGCCACCGGCAGAATAGGTCTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025998
ATGATCCTAAACAATCATAATCTGATTGTAGGACATCAAATTCCAACAGCCAACAGGAGATATTGTGATAGGGAACGTGAGTTTGGTGCAGAGCATTTGATCAACGACTACTTCAACGACAACCCAACGTATACTCCAGAGCTCTTCCGACGGAAATTTTGCATGCAGAAATCGCTATTCGTTCGAATAGTGGAAGCTGTTACTGCTAATGATGAATTTTTTCAACAGAGACGAGATGCCACCGGCAGAATAGGTCTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811762.1
MILNNHNLIVGHQIPTANRRYCDREREFGAEHLINDYFNDNPTYTPELFRRKFCMQKSLFVRIVEAVTANDEFFQQRRDATGRIGLSSLQKCTGAMRVLAYGTSSDVADEYLQMSSSSTRDALVYFVEGVISCFGGTYLRRPNEEDLARLLYVGEQHGFPSMIGSIDCMHWEWKNYPNAWAGQYTGRSGKSTIILEAVASYDLWIWHAFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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