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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003446`

染色体: Chr05 坐标: 45828056-45829197 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003446`
名称	SmilChr05G003446
描述	uncharacterized SmilChr05G003446
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45828056 - 45829197 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026000`
GeneID	`131026000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026000`
原始查询	`SmilChr05G003446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=21.2; qcov=0.775; evalue=6.73e-07; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=32.8; qcov=0.839; evalue=1.12e-33; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811764.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811764.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811764.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811764.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45828123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B127,D2
`Chr5:45828123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr5:45828133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C60
`Chr5:45828180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:45828186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B40,C33
`Chr5:45828263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A7,B100,B139
`Chr5:45828263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B100,B139
`Chr5:45828301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B29,B73,B97,D8
`Chr5:45828301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B73,B97,D8
`Chr5:45828306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B112,B122
`Chr5:45828350`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B1,B104,B117,B133,B2,B37,B46,B64,B93,C11,C46,C60,C69,C82
`Chr5:45828357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C35,C48

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955781.1
ATGGCAAAGCTGAGATCCATAAACAAAAAGGCAGCAGATGAGCTTTTACACTATCCGCAACAACACTGGTGTAGGGCCTATCAAAGCACTAGATGCTCAACTCATATGGTAGACAACAACTGCTCTGAATCTTTTAATTCTAGTATAAGTGATGCTAGGCATAAACCTATTATCAGCATGTTAGAAGATATTAGGTTGTTGGCTATGCAAAGAATTAGAGATAGGAAAGTTGCTTTGCAAAGTTGGAAAACTGACTGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026000
ATGGCAAAGCTGAGATCCATAAACAAAAAGGCAGCAGATGAGCTTTTACACTATCCGCAACAACACTGGTGTAGGGCCTATCAAAGCACTAGATGCTCAACTCATATGGTAGACAACAACTGCTCTGAATCTTTTAATTCTAGTATAAGTGATGCTAGGCATAAACCTATTATCAGCATGTTAGAAGATATTAGGTTGTTGGCTATGCAAAGAATTAGAGATAGGAAAGTTGCTTTGCAAAGTTGGAAAACTGACTGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811764.1
MAKLRSINKKAADELLHYPQQHWCRAYQSTRCSTHMVDNNCSESFNSSISDARHKPIISMLEDIRLLAMQRIRDRKVALQSWKTDWAPNAMKMFEANKTDSVDCHVVWNGEYGYEVSDGEDRHIVFVDTKTCTCRAWELTGIAMPYAHSIQPLPGVKFWNVKEEDAIEPPPVEKKIGRPKKNRVRTPNEPKHRHKLSRVGKAQHCSLCGSETHKKNSCSLNPKKVDQNAEASTSSKPKRKAAAGLGLYVNLETGKQVLNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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