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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003447`

染色体: Chr05 坐标: 45847082-45852499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003447`
名称	SmilChr05G003447
描述	F-box protein SKIP8-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45847082 - 45852499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024534`
GeneID	`131024534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024534`
原始查询	`SmilChr05G003447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP8-like
产物	F-box protein SKIP8-like
Arabidopsis	`AT4G10925` (AT4G10925) Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826691] identity=50; qcov=0.798; evalue=3.26e-51; confidence=high
Rice	`Os01g0550200` (OsFbox016) - identity=61.7; qcov=0.606; evalue=8.89e-49; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13474 (SnoaL_3); PF14534 (DUF4440)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810024.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810025.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810028.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810024.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45847787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:45847808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B93,D10
`Chr5:45847832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr5:45847875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr5:45849818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:45849877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:45850795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B53,C61
`Chr5:45850809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C24,C3
`Chr5:45850821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B93,D10
`Chr5:45850874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:45851556`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B132,B9
`Chr5:45851556`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B132,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810024.1

252 aa

126

252

SnoaL_3

PF13474 SnoaL_3 109-203 aa

XP_057810025.1

236 aa

118

236

SnoaL_3

PF13474 SnoaL_3 109-203 aa

XP_057810026.1

235 aa

118

235

SnoaL_3

PF13474 SnoaL_3 92-186 aa

XP_057810027.1

217 aa

108

217

DUF4440

SnoaL_3

PF14534 DUF4440 92-194 aa PF13474 SnoaL_3 92-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810024.1`	Pfam	`PF13474`	SnoaL_3	Domain	109	203	1.2e-13	52.1	SnoaL-like domain
`XP_057810025.1`	Pfam	`PF13474`	SnoaL_3	Domain	109	203	1.1e-13	52.3	SnoaL-like domain
`XP_057810026.1`	Pfam	`PF13474`	SnoaL_3	Domain	92	186	1.1e-13	52.3	SnoaL-like domain
`XP_057810027.1`	Pfam	`PF14534`	DUF4440	Domain	92	194	3.5e-06	28.2	Domain of unknown function (DUF4440)
`XP_057810027.1`	Pfam	`PF13474`	SnoaL_3	Domain	92	201	3.8e-19	69.9	SnoaL-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101897.1
TCTCATTTCAGTTACAAAACCACCATCAACTTAACCACCACCAACTTTCTCTCTCATCACCATCTGCACTCATTCTCTTCTCTCTCTAAAACCCCTAAATTAGGGTTTCATTTAAGGAGATACTCACCAGCGCCAGCACAGATTACACACGAAAGCGCAGTAAATGGGGCTTTTAAATCCAAAATTCTCCCCACCTGATAAAAAAGCAAGACACTGAGGAAAAAGAGTGATTTTTCGTCATTGCTGGTAGCCCTGTCCGC...

XM_057954044.1
CTCCCACCACCCTTTTTCCCCTCTCATTTCAGTTACAAAACCACCATCAACTTAACCACCACCAACTTTCTCTCTCATCACCATCTGCACTCATTCTCTTCTCTCTCTAAAACCCCTAAATTAGGGTTTCATTTAAGGAGATACTCACCAGCGCCAGCACAGATTACACACGAAAGCGCAGTAAATGGGGCTTTTAAATCCAAAATTCTCCCCACCTGATAAAAAAGCAAGACACTGAGGAAAAAGAGAATGGAATAGAC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131024534
ATGCCTTCTGTTTGTGTGGGTGAACAGAATGGAATAGACTGTGGCGAGAGAATGACTGTGCCTGTGGATGGTGGGAAGATGGAGAAGGAGTGGGAGACGGGGACATCGATAATTGAGCAACTGGTGCCGGAGATAAGAATGCATGCACTCACCTTCTTGGATTACCCAAGCCTCTGCGGTCTGTCGATGACGAATTCGCTCCTGCATAGAGCTGCCAATGATGAGAGTGTATGGAAGGCGCTCTATCTTAAGGATTTCTC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057810024.1
MPSVCVGEQNGIDCGERMTVPVDGGKMEKEWETGTSIIEQLVPEIRMHALTFLDYPSLCGLSMTNSLLHRAANDESVWKALYLKDFSLEQGNVKPANGWKAYYAATVAIVKCNAEFYRIVKERSHSAISQFWHNAGYVKCFHANGKSFTGYNEVMESWRVAFSWENVIDFQIRDVRTRVLTDMAWVTMKAFADMERAYNVTNIYELCNGIRRRPDKDFQGNVSKHGMKDRPGHHLWTERFCLPPLHLLPFTT

XP_057810025.1
MPSVCVGEQNGIDCGERMTVPVDGGKMEKEWETGTSIIEQLVPEIRMHALTFLDYPSLCGLSMTNSLLHRAANDESVWKALYLKDFSLEQGNVKPANGWKAYYAATVAIVKCNAEFYRIVKERSHSAISQFWHNAGYVKCFHANGKSFTGYNEVMESWRVAFSWENVIDFQIRDVRTRVLTDMAWVTMKAFADMERAYNVTNIYELCNGIRRRPDKDFQGNGGFDHGKFMFWVVGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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