当前解析结果
SmilChr05G003467| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003467 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003467 |
| 描述 | ent-kaurenoic acid oxidase 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 46048617 - 46053339 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024550 |
|---|---|
| GeneID | 131024550 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024550 |
| 原始查询 | SmilChr05G003467 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ent-kaurenoic acid oxidase 2-like |
| 产物 | ent-kaurenoic acid oxidase 2-like |
| Arabidopsis | AT2G32440 (KAO2)ent-kaurenoic acid hydroxylase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817805] identity=33.26; qcov=0.921; evalue=9.96e-88; confidence=low |
| Rice | Os10g0378000- identity=45.17; qcov=0.981; evalue=1.12e-156; confidence=high |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0007275 (multicellular organism development); GO:0010268 (brassinosteroid homeostasis); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016132 (brassinosteroid biosynthetic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024550 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057810049.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057810049.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:46048879 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr5:46049302 |
C |
CTG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A2,B28,B33,B70,B82,C18,C29,C72,C78,D2 |
Chr5:46051423 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr5:46051472 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr5:46051582 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr5:46051665 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B127 |
Chr5:46051665 |
C |
CTT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr5:46052401 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:46052436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C28,D1,D11 |
Chr5:46052873 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr5:46052999 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C28 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810049.1PF00067
p450 51-458 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810049.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 51 | 458 | 9e-62 | 210.1 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。