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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003472`

染色体: Chr05 坐标: 46101364-46103598 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003472`
名称	SmilChr05G003472
描述	NADP-dependent malic enzyme-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46101364 - 46103598 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026003`
GeneID	`131026003`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026003`
原始查询	`SmilChr05G003472`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADP-dependent malic enzyme-like
产物	NADP-dependent malic enzyme-like
Arabidopsis	`AT1G79750` (NADP-ME4) NADP-malic enzyme 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844314] identity=79.2; qcov=0.851; evalue=3.93e-82; confidence=high
Rice	`Os01g0188400` (NADP-ME) - identity=75.8; qcov=0.851; evalue=5.71e-82; confidence=high
GO	GO:0004471 (malate dehydrogenase (decarboxylating) (NAD+) activity); GO:0004473 (malate dehydrogenase (decarboxylating) (NADP+) activity); GO:0006090 (pyruvate metabolic process); GO:0006108 (malate metabolic process); GO:0009507 (chloroplast); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF03949 (Malic_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026003

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811767.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811767.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057811767.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811767.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46102077`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C18
`Chr5:46102077`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C18
`Chr5:46102107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr5:46102402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr5:46102515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:46102704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr5:46102725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B2,B98,C53,D5
`Chr5:46102737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:46102757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B126
`Chr5:46102935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:46102966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C42
`Chr5:46103224`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	118	A13,A16,A19,A20,A21,A25,B100,B101,B103,B105,B106,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B120,B121,B122,B125,B127,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B139,B140,B18,B19,B20,B21,B22,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B41,B42,B43,B49,B50,B52,B53,B6,B69,B71,B74,B75,B77,B79,B82,B86,B89,B90,B92,B94,B95,B99,C1,C10,C11,C12,C18,C19,C2,C20,C25,C28,C29,C3,C30,C34,C35,C40,C41,C42,C46,C49,C52,C54,C55,C57,C58,C59,C64,C65,C66,C68,C69,C70,C73,C75,C76,C79,C83,C85,C86,C87,D2,D3,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811767.1

175 aa

175

Malic_M

PF03949 Malic_M 26-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811767.1`	Pfam	`PF03949`	Malic_M	Domain	26	174	3.2e-54	184.7	Malic enzyme, NAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955784.1
ATGAGTGCGATTTTATTACAGAGTTATGAGAAGGCACCGAGCCACTGCATTTCAGATGCTAGCTTATGTAATTTACAGGCTGGAACCGGCATAGCTGAACTTATCGCGCTTGAGATGTCCAAAAGGGCAAACACTCCAGTCGAGGAGGCAAGGAAGAAAATTTGGCTTGTGGACTCTAAGGGGTTGATTGTCAGCTCTCGTAAAGAGTCTCTTCAGCATTTCAAACTGCCTTGGGCTCACGAGCACGAACCAGTTCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026003
ATGAGTGCGATTTTATTACAGAGTTATGAGAAGGCACCGAGCCACTGCATTTCAGATGCTAGCTTATGTAATTTACAGGCTGGAACCGGCATAGCTGAACTTATCGCGCTTGAGATGTCCAAAAGGGCAAACACTCCAGTCGAGGAGGCAAGGAAGAAAATTTGGCTTGTGGACTCTAAGGGGTTGATTGTCAGCTCTCGTAAAGAGTCTCTTCAGCATTTCAAACTGCCTTGGGCTCACGAGCACGAACCAGTTCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811767.1
MSAILLQSYEKAPSHCISDASLCNLQAGTGIAELIALEMSKRANTPVEEARKKIWLVDSKGLIVSSRKESLQHFKLPWAHEHEPVQELLDAVKEIKPSVLIGTSGVGRTFTKEAVEAMAANNEKPLILTLSNPTSQSECTAEEAYTWSEGRAIFASGSPFPPVEYNGKTYATGQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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