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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003477`

染色体: Chr05 坐标: 46154175-46155231 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003477`
名称	SmilChr05G003477
描述	(-)-isopiperitenol/(-)-carveol dehydrogenase, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46154175 - 46155231 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024556`
GeneID	`131024556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024556`
原始查询	`SmilChr05G003477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(-)-isopiperitenol/(-)-carveol dehydrogenase, mitochondrial-like
产物	(-)-isopiperitenol/(-)-carveol dehydrogenase%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G47140` (SDR5) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819327] identity=50.2; qcov=0.937; evalue=2.26e-76; confidence=high
Rice	`Os03g0833100` - identity=52.6; qcov=0.978; evalue=1.2e-77; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810055.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810055.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057810055.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810055.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46154413`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr5:46154413`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr5:46154543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B6,C39,C56
`Chr5:46154575`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A22,B126,B137,B21,B24,B4,B66,B67,B68,B79,C19,C31,C34,C38,C48,C58,C67,C82,C86,D1,D5
`Chr5:46154635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B131,B46,D6
`Chr5:46154650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:46154680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,C62,C82
`Chr5:46154685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:46154709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,C62,C82
`Chr5:46154768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:46154773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C28,C44,C8
`Chr5:46154816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810055.1

270 aa

135

270

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 14-204 aa PF08659 KR 17-178 aa PF13561 adh_short_C2 22-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810055.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	14	204	5.1e-47	160.6	short chain dehydrogenase
`XP_057810055.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	17	178	1.4e-08	35.6	KR domain
`XP_057810055.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	22	259	5e-56	190.6	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954072.1
CTCTATATATATACACCCCTTGATCCACACTATCCTCTGAAACACATCCTAGTAAAATTTTCAAAAATGGCAAACAATTTACTCAATAAGAAAAAGCTTGAAGGCAAGGTCGCCATCGTAACCGGCGGCGCCAGCGGCATAGGCGAGGCCACCGCTCGACTCTTTGCCGAATACGGCGCACGAGCGGTGGTGATCGCCGATATCCAATCCGAGAAGGGCCACGCCGTGGCCGAATCCATCGGCCTGCAGCGATGCAGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024556
ATGGCAAACAATTTACTCAATAAGAAAAAGCTTGAAGGCAAGGTCGCCATCGTAACCGGCGGCGCCAGCGGCATAGGCGAGGCCACCGCTCGACTCTTTGCCGAATACGGCGCACGAGCGGTGGTGATCGCCGATATCCAATCCGAGAAGGGCCACGCCGTGGCCGAATCCATCGGCCTGCAGCGATGCAGCTACATCCACTGCGACGTCGCCGTCGAGGAACAGGTCGTGGCCATGATAGAATGGACCGCCGCAACCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810055.1
MANNLLNKKKLEGKVAIVTGGASGIGEATARLFAEYGARAVVIADIQSEKGHAVAESIGLQRCSYIHCDVAVEEQVVAMIEWTAATYGGVDIMFSNAGISSSSAQSVLELDLAEFDRVMRVNARGMAVCVKQAARKMVELRTGGAIICTASTAAEKGGANLTDYVMSKRAVLGLMRSASMELGLHGIRVNSVSPGGVLTPIVANHGILTAADMENYVGPFTSLKGVTLKAENVAEAAAFLASDEAAFVTGVDLAVDGGMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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