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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003480`

染色体: Chr05 坐标: 46202097-46206198 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003480`
名称	SmilChr05G003480
描述	uncharacterized SmilChr05G003480
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46202097 - 46206198 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024559`
GeneID	`131024559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024559`
原始查询	`SmilChr05G003480`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0610000` - identity=28.6; qcov=0.583; evalue=2.82e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810057.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810057.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810057.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810057.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46202838`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr5:46202838`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr5:46202934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C77
`Chr5:46203076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B114,B120,B18,B48,C24,C27
`Chr5:46203087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:46203108`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A14,A19,A6,B114,B117,B120,B136,B18,B38,B4,B45,B54,B7,B72,B83,B97,C24,C27,C28,C3,C31,C40,C49,C64,C65,C81,D7
`Chr5:46203143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:46203145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D1
`Chr5:46203162`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	C27,C45,C51,C62,C85
`Chr5:46203162`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	C27,C45,C51,C62,C85
`Chr5:46203164`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C27,C85
`Chr5:46203164`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C27,C85

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954074.1
CAGGCAGCACATGTCCTATTTGAGGACAACATATGCTAGACAGTCTAAGAATTTAACATGGTTACAAGACGAGCACCATCGATCATTCATTACTTGGTTGCGTGAACGAGTAACAAAGGAGAATGCCCAAATATTTGGTAAAATCAAGTGGATTGCGAAGGGACCTAGAAACTCTGTTTTCAAGTATCAAAGTTACTTGATTAATGGAGTAACATACTATACAAAAAAGCTTGATGCAGTACGTGCAGTCCAAAATTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024559
ATGTCCTGCACCACCCTTGTCTTAGTAAAGAGTTTCCTAATAAAGATGATGATAGTACGGACGACAATGAACCACTATATATCCGTTCAGATTGTGATGGGATTTGGATTGAACATGACAAATAAATCAATGAGATTCATGACAACCATGCGTACACGAAGAAAACAGCAAGGCTTGTCTGAGTTTAATAAAAAAAGACGATTAGAGGACAACAGCAAAGATGCAGATGTTGAACTGTTTGATAACAATGCAGTAGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810057.1
MSCTTLVLVKSFLIKMMIVRTTMNHYISVQIVMGFGLNMTNKSMRFMTTMRTRRKQQGLSEFNKKRRLEDNSKDADVELFDNNAVADSQSTKSNSKSSQCSRSKRGRTQMHCLAMQRVQGVKQDVELNELGQPIGKAGTQLQSYIGVLAREKVKITFETWHNVPEDVKEDIWESVNLSFNVDSSWRDSCISSANDKWRQFKTKLTNEYVYGRADSPEEMQTPPEKYPSISQTEWTTFIIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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