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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003493`

染色体: Chr05 坐标: 46469196-46471237 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003493`
名称	SmilChr05G003493
描述	ubiquitin-related modifier 1 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46469196 - 46471237 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024570`
GeneID	`131024570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024570`
原始查询	`SmilChr05G003493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-related modifier 1 homolog 1-like
产物	ubiquitin-related modifier 1 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT2G45695` (AT2G45695) Ubiquitin related modifier 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007965] identity=85.2; qcov=1.02; evalue=3.48e-56; confidence=high
Rice	`Os07g0466300` (slg) - identity=70; qcov=1.01; evalue=1.1e-45; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0031386 (protein tag activity); GO:0032447 (protein urmylation); GO:0034227 (tRNA thio-modification)
KEGG	smil04122 (Sulfur relay system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09138 (Urm1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810074.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810074.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810074.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057810074.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810074.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46470385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B85,C15,C21,C5
`Chr5:46470409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B13,B35,D5
`Chr5:46470872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B104,C1,D11
`Chr5:46470911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B117,C50
`Chr5:46470913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C1
`Chr5:46470925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C28,C9
`Chr5:46470959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,B91,C12,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810074.1

99 aa

Urm1

PF09138 Urm1 3-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810074.1`	Pfam	`PF09138`	Urm1	Domain	3	99	7.1e-38	129.6	Urm1 (Ubiquitin related modifier)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954091.1
AAAAGTTATTTGAATTAATTTTTTTTAGAAGAAGTATTTGAATTATAAATGACAAGATTCTGACAAAAATCGCCTGATAAATCATCCCAAAAAATGCATATATGGCTGATTCACACAGCCCACAACCGAAATCCAAAGGGAGCCCGATTTATAGACCTTGGAGATTCGATTTCTTTACGTCCGGGACTGACCCGTTTCGATCCGATCCGAGCTAACTGAATTTGTGCAGCGATCGAAAACTCCAATCGAATCCCTAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024570
ATGCAGCTCACTCTCGAATTCGGTGGTGGACTTGAACTTCTATGTGATTCTGTCAAGATCCATGATGTGAATGTTGAGCCACAAGGTGAAGAAAAGAAGCTAACTGTGAAACACTTGCTCTCGTGGGTCCGTACGAATTTGATCAAGGAAAGACCCGAAATGTTTATGAAAGGAGACACAGTGAGACCTGGCGTTCTAGTCCTCGTAAATGACTGTGATTGGGAACTAAGCGGGCAGCTTGAGACGGTACTGGAAGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810074.1
MQLTLEFGGGLELLCDSVKIHDVNVEPQGEEKKLTVKHLLSWVRTNLIKERPEMFMKGDTVRPGVLVLVNDCDWELSGQLETVLEEKDVVVFISTLHGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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