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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003498`

染色体: Chr05 坐标: 46643576-46647459 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003498`
名称	SmilChr05G003498
描述	uncharacterized SmilChr05G003498
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46643576 - 46647459 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026017`
GeneID	`131026017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026017`
原始查询	`SmilChr05G003498`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT4G14620; symbol=AT4G14620; hit=AT4G14620; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT4G14620; symbol=AT4G14620; hit=AT4G14620; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G14620` (AT4G14620) - identity=31.4; qcov=1.2; evalue=1.9e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0796600` - identity=26; qcov=1.3; evalue=2.91e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04720 (PDDEXK_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811781.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811781.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811781.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811781.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46643606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B43,C25
`Chr5:46643636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C61
`Chr5:46643657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr5:46643659`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr5:46643659`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr5:46643669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:46643699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B80,C61
`Chr5:46643781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,C3,C8
`Chr5:46643861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr5:46643888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B38,B7
`Chr5:46643889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C3
`Chr5:46643923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811781.1

157 aa

157

PDDEXK_6

PF04720 PDDEXK_6 114-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811781.1`	Pfam	`PF04720`	PDDEXK_6	Family	114	144	6.5e-18	66.2	PDDEXK-like family of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955798.1
ATGCCGCCTCAAACACTGCACCAAATTCGCTTATTTCACTCTGCAAAAACCCCTGCTCGTTACCACCGCCGGAAACTACCAACTTCCCACCTTCCTCTGCCGCCGCGAAATGCGCCCGCGCGCAACCGCTGCAATTGCTTCAACGGCAACAGCAACGATAGCTCCGATGACGAGCTCGATTTCTTCTCCGATTCGATTTCCGCTAATTCTTCCTTCGGCAACCCCTCCGATAACGCCTCTCTTTGCAAATCCAAATGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026017
ATGCCGCCTCAAACACTGCACCAAATTCGCTTATTTCACTCTGCAAAAACCCCTGCTCGTTACCACCGCCGGAAACTACCAACTTCCCACCTTCCTCTGCCGCCGCGAAATGCGCCCGCGCGCAACCGCTGCAATTGCTTCAACGGCAACAGCAACGATAGCTCCGATGACGAGCTCGATTTCTTCTCCGATTCGATTTCCGCTAATTCTTCCTTCGGCAACCCCTCCGATAACGCCTCTCTTTGCAAATCCAAATGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811781.1
MPPQTLHQIRLFHSAKTPARYHRRKLPTSHLPLPPRNAPARNRCNCFNGNSNDSSDDELDFFSDSISANSSFGNPSDNASLCKSKWDKSPSIPAGNSQFHFPPFFLFNTPISPKTARQSLKKKGMHIAPWRKADYMKSKWLSPHAAQNRHRRGGSAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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