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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003501`

染色体: Chr05 坐标: 46657429-46661512 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003501`
名称	SmilChr05G003501
描述	uncharacterized SmilChr05G003501
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	46657429 - 46661512 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024541`
GeneID	`131024541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024541`
原始查询	`SmilChr05G003501`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0111700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os06g0111700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G35540` (AT2G35540) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818119] identity=48.9; qcov=0.279; evalue=1.06e-63; confidence=weak
Rice	`Os06g0111700` - identity=47.1; qcov=0.283; evalue=5.09e-64; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF11926 (DUF3444)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810033.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810033.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810033.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810033.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810033.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:46657843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C1
`Chr5:46657915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr5:46657926`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr5:46657926`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr5:46657949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B51,B58,B99,C1
`Chr5:46657996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A21,B51,B58,B99,C27
`Chr5:46657996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B51,B58,B99,C27
`Chr5:46658018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B51,B58,B99,C27
`Chr5:46658034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B51,B58,C27
`Chr5:46658037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B27
`Chr5:46658061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B58,B99,C27
`Chr5:46658118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810033.1

842 aa

421

842

DnaJ

DUF3444

PF00226 DnaJ 87-148 aa PF11926 DUF3444 610-818 aa

XP_057810034.1

842 aa

421

842

DnaJ

DUF3444

PF00226 DnaJ 87-148 aa PF11926 DUF3444 610-818 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810033.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	87	148	2.5e-19	69.9	DnaJ domain
`XP_057810033.1`	Pfam	`PF11926`	DUF3444	Family	610	818	5.7e-65	219.6	Domain of unknown function (DUF3444)
`XP_057810034.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	87	148	2.5e-19	69.9	DnaJ domain
`XP_057810034.1`	Pfam	`PF11926`	DUF3444	Family	610	818	5.7e-65	219.6	Domain of unknown function (DUF3444)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954051.1
TGGAGTTGGTATCCCAGGAATTTAGGATATACGTTGTTAGAGTTGGATAGTATACGCTACAAAATTATCCTCAATTATTACGTAGGCATACAAGTTAAGTTGTTGGGCCTAATTGCAAAAATAGGATTAAAAATAAGTGAAAATTGGGGGGTGGGTTTCTACTTTCTACTGCTACCAGAATCTTTACTTCTACCGGGAAAAACCCTTCCACCATTTCTCCCCGTCACCAAATTCCCATTCACCTCTGCAACAATGTCCGA...

XM_057954050.1
TGGAGTTGGTATCCCAGGAATTTAGGATATACGTTGTTAGAGTTGGATAGTATACGCTACAAAATTATCCTCAATTATTACGTAGGCATACAAGTTAAGTTGTTGGGCCTAATTGCAAAAATAGGATTAAAAATAAGTGAAAATTGGGGGGTGGGTTTCTACTTTCTACTGCTACCAGAATCTTTACTTCTACCGGGAAAAACCCTTCCACCATTTCTCCCCGTCACCAAATTCCCATTCACCTCTGCAACAATGTCCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024541
ATGTCCGAGAAAGATGACAAATCGGGCTCAATTGACGCAGCCCGCCCCAAAGAAGAAGCCCTCCGCCTCAAAACCCTAGCGGAGGAGAAGTACAATTCCGGCGACCTCACCTCCGCCGTCGCATACGCCGAGCGCGCCCGCGACCTCCATCCCTCCATCTCCGGCCTGCGCCAGATGCTCACCGCCTTCCAAATCCTCCGCGCCGCTGCCGCGTACCCATTTCCCGACGGCGGCGCCGAGAGGCAGAAGCCAACTCCGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810033.1
MSEKDDKSGSIDAARPKEEALRLKTLAEEKYNSGDLTSAVAYAERARDLHPSISGLRQMLTAFQILRAAAAYPFPDGGAERQKPTPDYYRILQVQRFSHINSIKKQYKKLALTLHPDKNPFVASEEAFKLVGEAARVLSDKIRRKEYDIRLRIAMQSEAAGAVAVELGEEGSRETFWTACSACRLLHQFERKYLGHNLICPGCKKTFKAMEAEERNEDEGKNEKNEANTRVSARIQERVAKGGYVGSVEKFGLGVKRRNS...

XP_057810034.1
MSEKDDKSGSIDAARPKEEALRLKTLAEEKYNSGDLTSAVAYAERARDLHPSISGLRQMLTAFQILRAAAAYPFPDGGAERQKPTPDYYRILQVQRFSHINSIKKQYKKLALTLHPDKNPFVASEEAFKLVGEAARVLSDKIRRKEYDIRLRIAMQSEAAGAVAVELGEEGSRETFWTACSACRLLHQFERKYLGHNLICPGCKKTFKAMEAEERNEDEGKNEKNEANTRVSARIQERVAKGGYVGSVEKFGLGVKRRNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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