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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003520`

染色体: Chr05 坐标: 47016842-47018959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003520`
名称	SmilChr05G003520
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 25
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47016842 - 47018959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024592`
GeneID	`131024592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024592`
原始查询	`SmilChr05G003520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 25
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 25
Arabidopsis	`AT4G19003` (VPS25) E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827637] identity=78.2; qcov=1; evalue=3.33e-109; confidence=high
Rice	`Os01g0658500` (P0694A04.40-1) - identity=73.6; qcov=0.994; evalue=1.34e-102; confidence=high
GO	GO:0000814 (ESCRT II complex); GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0042803 (protein homodimerization activity); GO:0043328 (protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05871 (ESCRT-II)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810077.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810077.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810077.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057810077.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057810077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47017473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:47017490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:47017636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr5:47017823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B100,B31,B80,C41
`Chr5:47017864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:47018744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810077.1

179 aa

179

ESCRT-II

PF05871 ESCRT-II 12-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810077.1`	Pfam	`PF05871`	ESCRT-II	Family	12	145	4.1e-46	157.4	ESCRT-II complex subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954094.1
CATTTTAACTTTGTGTGCTGTAAGCGGGTAGGCTGACCCAACCCGACCCGGTCGAATGTGGCCTGGAATCGTGCGCTGATGCTGCCTTCTTCCATCGGTTTCACCTAAAACCCCTTCAAAGAGCAATCTTAAGATTTTGGAGTTTACAATCTAATTGGGAGGCAAAGAGCGACGGATATGCAGACTTTGGGTGAATTCAAGCTGCCCCATTTCTTCAATTACCCTCCTTATTTCACTTTGCAGCCAGTAAAAGACACCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024592
ATGCAGACTTTGGGTGAATTCAAGCTGCCCCATTTCTTCAATTACCCTCCTTATTTCACTTTGCAGCCAGTAAAAGACACCAGGGAGAAGCAGATACAGCTCTGGAAGGAGCTGATACTCGAATATTGTCGGGGACACAAAATCTTTGTAGTTGGACTTGATGAAGACTTCCCGTTGTTTAGCAATCAAGTAATTGAAAGATCCCTAAGTCATGAAGCTAGGGAGGCATTTCTCTCAGCCTTAGTTTCCGATGGACGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810077.1
MQTLGEFKLPHFFNYPPYFTLQPVKDTREKQIQLWKELILEYCRGHKIFVVGLDEDFPLFSNQVIERSLSHEAREAFLSALVSDGRAEWLDKSHRKCLLLWHRIPDWADLIISFVRDNGLEDSVMTVEEIRSGVESRGTELHGMERSILMRALKHLEHRGKLAIFKGTSADDEGIKFSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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