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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003528`

染色体: Chr05 坐标: 47150997-47157095 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003528`
名称	SmilChr05G003528
描述	uncharacterized SmilChr05G003528
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47150997 - 47157095 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024600`
GeneID	`131024600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024600`
原始查询	`SmilChr05G003528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SEC14 cytosolic factor family protein / phosphoglyceride transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823795]; symbol=AT3G46450; hit=AT3G46450; species=arabidopsis; confidence=high
产物	SEC14 cytosolic factor family protein / phosphoglyceride transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823795]; symbol=AT3G46450; hit=AT3G46450; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G46450` (AT3G46450) SEC14 cytosolic factor family protein / phosphoglyceride transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823795] identity=50.6; qcov=1.01; evalue=1.1e-160; confidence=high
Rice	`Os03g0820900` (OJ1754_E06.24) - identity=45.4; qcov=0.981; evalue=4.03e-141; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057810091.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057810091.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057810091.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057810091.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47152729`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C50
`Chr5:47152729`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C50
`Chr5:47152870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:47153524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:47155550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C76
`Chr5:47156134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B106,B112,B129,B61,C20,C29,C47
`Chr5:47156218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B133,C20,C29,C47
`Chr5:47156659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B48,B98,C35,C61,C80
`Chr5:47156679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B138,B60,B91,C25
`Chr5:47156837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810091.1

476 aa

238

476

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 238-385 aa

XP_057810092.1

476 aa

238

476

CRAL_TRIO

PF00650 CRAL_TRIO 238-385 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810091.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	238	385	4.1e-26	92.3	CRAL/TRIO domain
`XP_057810092.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	238	385	4.1e-26	92.3	CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954109.1
AAGTCGCACGTGACGGAACTGCGCCGAAATAAGTAGCAGCTTCCCAACTGTAACCAACCTCACCCCACCCCACCCCACCCCACCCCACCGTCCTCAACAATTCTGAAACCTTCTGCGTTTCTACTTTCTTCGCCTTCTCTCTCTATTCCTCTTTCATTGATTTTTCTCCGCTTTCCCATGTGTTCTATCTTCTTATTTATTCTTATTCCAATTTGACTCCAAGAGGAGCTTCATCGACAGGATTGAGCAACTATGTTTTG...

XM_057954108.1
ACCCCACCCCACCCCACCCCACCCCACCGTCCTCAACAATTCTGAAACCTTCTGCGTTTCTACTTTCTTCGCCTTCTCTCTCTATTCCTCTTTCATTGATTTTTCTCCGCTTTCCCATGTGTAAGCTTTGCATTCATTCTCTCTTTTCCGGTGCTTCTTTGTTAATTTCTTGCCATCGTTCTATCTTCTTATTTATTCTTATTCCAATTTGACTCCAAGAGGAGCTTCATCGACAGGATTGAGCAACTATGTTTTGAAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024600
ATGGCCAATGTTGTCAATAATAAAAATGTGTCACGAAGGCCTTCGATTGCTTCTGGCCCTAAATCCGTTTTAAATCAGTCTTTAAGACCAATAACATCACATAAGTGGGAAATTGGAAAGGGAACTGGTGTTCAGGTGGCAACTTTTCTTGCTAAAACGATTGCATTAGAGACTGTGCGGAGGTTATCGAGGGCCAAATGCCCAGTTCTCTGGACTGGACTGCAAGGGTTACAAGTACTTTGTTGTCCCCCATTCAAATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810091.1
MANVVNNKNVSRRPSIASGPKSVLNQSLRPITSHKWEIGKGTGVQVATFLAKTIALETVRRLSRAKCPVLWTGLQGLQVLCCPPFKWVQRWKPFGFLVHGMQMISRPLLVLSIANALYDHSECSTLDLDDAENSPSHDDSQLGSENLSGPPSLECNQNMRIGGENREGLLSTDWANHLCHELETQGITLPERINLEELQRFYVAADGDFSTLLSSIKKTIKWRETYRILSGEELELWSNLIFWHGLDVNHRPCLVVRLGL...

XP_057810092.1
MANVVNNKNVSRRPSIASGPKSVLNQSLRPITSHKWEIGKGTGVQVATFLAKTIALETVRRLSRAKCPVLWTGLQGLQVLCCPPFKWVQRWKPFGFLVHGMQMISRPLLVLSIANALYDHSECSTLDLDDAENSPSHDDSQLGSENLSGPPSLECNQNMRIGGENREGLLSTDWANHLCHELETQGITLPERINLEELQRFYVAADGDFSTLLSSIKKTIKWRETYRILSGEELELWSNLIFWHGLDVNHRPCLVVRLGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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